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Enregistrement W4407119269

Identification and characterization of luminal progenitor cells in prostate cancer in men

2023· dissertation· en· W4407119269 sur OpenAlexaboutno aff
Charles Dariane

Notice bibliographique

Revuetheses.fr (ABES) · 2023
Typedissertation
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProstate cancerIdentification (biology)Progenitor cellProgenitorBiologyCancerComputational biologyCancer researchMedicineInternal medicineCell biologyStem cellBotany
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction : Le cancer de la prostate (CaP) est le cancer le plus fréquent chez l'homme vieillissant et correspond à une prolifération de cellules luminales. Malgré une évolution indolente et des traitements curatifs, 10-15% des patients avec CaP initialement localisé vont récidiver et développer des métastases. Le traitement repose alors sur l'hormonothérapie de suppression androgénique (SAd), avec une évolution inéluctable vers la résistance à la castration (CPRC) responsable du décès. L'absence de connaissances exhaustives sur les mécanismes moléculaires et cellulaires de la résistance ont empêché jusqu'ici d'établir des biomarqueurs pronostiques et prédictifs fiables. Toutefois, récemment, la mise en évidence de cellules luminale progénitrices (LSCᵐᵉᵈ), capables d'initier le développement tumoral en présence ou absence d'androgènes, dans un modèle murin développant des CPRCs, a permis de reproduire la progression tumorale observée chez les patients sous SAd. Durant ma thèse, il a été montré qu'un contingent cellulaire augmente dans les CPRCs, potentiellement par avantage sélectif et/ou par processus de plasticité cellulaire permettant aux cellules luminales tumorales d'adopter un phénotype de type LSCᵐᵉᵈ. Les cellules présentant un fort enrichissement dans la signature transcriptomique LSCᵐᵉᵈ ont été identifiées dans des échantillons prostatiques humains sains et tumoraux suggérant une translation possible chez l'homme de l'hypothèse cellulaire, et faisant intervenir potentiellement des processus de transition épithélio-mésenchymateuse. L'objectif de la thèse a été d'identifier la localisation et le devenir des LSCᵐᵉᵈ dans des échantillons humains prostatiques bénins et tumoraux, avant et après SAd, à l'aide du développement de biomarqueurs, de la mise en place de la transcriptomique spatiale et grâce au développement de modèles d'étude en 3D des tumeurs épithéliales prostatiques humaines. Résultats : Une analyse par immuno-fluorescence de plusieurs biomarqueurs des LSCᵐᵉᵈ a été réalisée sur un TMA (Tissue Micro-Array) comprenant des échantillons de prostatectomies radicales de 285 patients avec CaP localisé, opérés au CHU de Montréal. L'expression protéique de la kératine 7 (KRT7) et de GPRC5a n'a pas été retrouvée dans les glandes tumorales (en dehors d'un marquage nucléaire de GPRC5a sur les cellules luminales tumorales). L'expression de KRT7 co-localisait avec l'expression de marqueurs des cellules basales des glandes bénignes adjacentes à la tumeur. L'analyse de l'intensité de fluorescence montre que l'expression forte de KRT7 ou GPRC5a est associée à la récidive métastatique à distance de la prostatectomie. Ces résultats sont retrouvés sur une 2nde cohorte multi-centrique pan-canadienne, malgré des intensités de fluorescence plus faible et une puissance statistique moindre. Les patients identifiés comme fort-expresseurs co-exprimaient souvent les 2 protéines dans les mêmes cellules épithéliales bénignes présentant un aspect d'hyperplasie cellulaire. Nos analyses sur la lignée cellulaire humaine tumorale prostatique HPV10 (cellules présentant un très fort enrichissement de la signature LSCᵐᵉᵈ) ont confirmé la présence des 2 marqueurs sur ces cellules en culture 2D et 3D (sphéroïdes), nous incitant à proposer que les cellules fortement positives pour KRT7/GPRC5a chez l'homme correspondaient bien aux LSCᵐᵉᵈ identifiées chez la souris. Discussion : L'expression de KRT7 en zone bénigne apparaît ainsi comme un biomarqueur prometteur. Afin de confirmer que les cellules KRT7+/GPRC5a+ fortement positives sont des cellules de type LSCᵐᵉᵈ et d'étudier finement leur biologie et leur résistance aux traitements, nous développons les stratégies de transcriptomique spatiale sur coupe de tissu tumoral de patient et la culture d'organoïdes issus de tumeur. Pour cela, en mobilisant les services d'urologie/pathologie de l'HEGP, nous avons mis en place la collecte d'échantillons permettant d'établir une biobanque de tissu frais/fixé.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,480
Score d'incertitude au seuil0,700

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,314 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2023
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