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Record W4407119269

Identification and characterization of luminal progenitor cells in prostate cancer in men

2023· dissertation· en· W4407119269 on OpenAlexaboutno aff
Charles Dariane

Bibliographic record

Venuetheses.fr (ABES) · 2023
Typedissertation
Languageen
FieldMedicine
TopicProstate Cancer Treatment and Research
Canadian institutionsnot available
Fundersnot available
KeywordsProstate cancerIdentification (biology)Progenitor cellProgenitorBiologyCancerComputational biologyCancer researchMedicineInternal medicineCell biologyStem cellBotany
DOInot available

Abstract

fetched live from OpenAlex

Introduction : Le cancer de la prostate (CaP) est le cancer le plus fréquent chez l'homme vieillissant et correspond à une prolifération de cellules luminales. Malgré une évolution indolente et des traitements curatifs, 10-15% des patients avec CaP initialement localisé vont récidiver et développer des métastases. Le traitement repose alors sur l'hormonothérapie de suppression androgénique (SAd), avec une évolution inéluctable vers la résistance à la castration (CPRC) responsable du décès. L'absence de connaissances exhaustives sur les mécanismes moléculaires et cellulaires de la résistance ont empêché jusqu'ici d'établir des biomarqueurs pronostiques et prédictifs fiables. Toutefois, récemment, la mise en évidence de cellules luminale progénitrices (LSCᵐᵉᵈ), capables d'initier le développement tumoral en présence ou absence d'androgènes, dans un modèle murin développant des CPRCs, a permis de reproduire la progression tumorale observée chez les patients sous SAd. Durant ma thèse, il a été montré qu'un contingent cellulaire augmente dans les CPRCs, potentiellement par avantage sélectif et/ou par processus de plasticité cellulaire permettant aux cellules luminales tumorales d'adopter un phénotype de type LSCᵐᵉᵈ. Les cellules présentant un fort enrichissement dans la signature transcriptomique LSCᵐᵉᵈ ont été identifiées dans des échantillons prostatiques humains sains et tumoraux suggérant une translation possible chez l'homme de l'hypothèse cellulaire, et faisant intervenir potentiellement des processus de transition épithélio-mésenchymateuse. L'objectif de la thèse a été d'identifier la localisation et le devenir des LSCᵐᵉᵈ dans des échantillons humains prostatiques bénins et tumoraux, avant et après SAd, à l'aide du développement de biomarqueurs, de la mise en place de la transcriptomique spatiale et grâce au développement de modèles d'étude en 3D des tumeurs épithéliales prostatiques humaines. Résultats : Une analyse par immuno-fluorescence de plusieurs biomarqueurs des LSCᵐᵉᵈ a été réalisée sur un TMA (Tissue Micro-Array) comprenant des échantillons de prostatectomies radicales de 285 patients avec CaP localisé, opérés au CHU de Montréal. L'expression protéique de la kératine 7 (KRT7) et de GPRC5a n'a pas été retrouvée dans les glandes tumorales (en dehors d'un marquage nucléaire de GPRC5a sur les cellules luminales tumorales). L'expression de KRT7 co-localisait avec l'expression de marqueurs des cellules basales des glandes bénignes adjacentes à la tumeur. L'analyse de l'intensité de fluorescence montre que l'expression forte de KRT7 ou GPRC5a est associée à la récidive métastatique à distance de la prostatectomie. Ces résultats sont retrouvés sur une 2nde cohorte multi-centrique pan-canadienne, malgré des intensités de fluorescence plus faible et une puissance statistique moindre. Les patients identifiés comme fort-expresseurs co-exprimaient souvent les 2 protéines dans les mêmes cellules épithéliales bénignes présentant un aspect d'hyperplasie cellulaire. Nos analyses sur la lignée cellulaire humaine tumorale prostatique HPV10 (cellules présentant un très fort enrichissement de la signature LSCᵐᵉᵈ) ont confirmé la présence des 2 marqueurs sur ces cellules en culture 2D et 3D (sphéroïdes), nous incitant à proposer que les cellules fortement positives pour KRT7/GPRC5a chez l'homme correspondaient bien aux LSCᵐᵉᵈ identifiées chez la souris. Discussion : L'expression de KRT7 en zone bénigne apparaît ainsi comme un biomarqueur prometteur. Afin de confirmer que les cellules KRT7+/GPRC5a+ fortement positives sont des cellules de type LSCᵐᵉᵈ et d'étudier finement leur biologie et leur résistance aux traitements, nous développons les stratégies de transcriptomique spatiale sur coupe de tissu tumoral de patient et la culture d'organoïdes issus de tumeur. Pour cela, en mobilisant les services d'urologie/pathologie de l'HEGP, nous avons mis en place la collecte d'échantillons permettant d'établir une biobanque de tissu frais/fixé.

Fetched live from OpenAlex and de-inverted. Abstracts are not stored in this database: the inverted indexes are 8.6 GB of the frame’s 9.3 GB of text, and the host has 13 GB free.

How this classification was reachedexpand

Full frame distilled prediction

Teacher imitation

Not calibrated prevalence, not ground truth. Human validation pending. Learned from the 10,348 direct Codex labels and 10,348 direct Gemma labels. Candidate is the union of thresholded teacher heads; consensus is their intersection. These outputs are machine_predicted_unvalidated and are not human labels or direct frontier model labels.

metaresearch head score (Codex)0.000
metaresearch head score (Gemma)0.000
Version: codex-gemma-dda1882f352aValidation status: machine_predicted_unvalidated
Candidate categoriesnone
Consensus categoriesnone
DomainCandidate signal: none · Consensus signal: none
Study designCandidate signal: Bench or experimental · Consensus signal: none
GenreCandidate signal: Empirical · Consensus signal: Empirical
Teacher disagreement score0.480
Threshold uncertainty score0.700

Codex and Gemma teacher scores by category

CategoryCodexGemma
Metaresearch0.0000.000
Meta-epidemiology (narrow)0.0000.000
Meta-epidemiology (broad)0.0000.000
Bibliometrics0.0010.001
Science and technology studies0.0000.000
Scholarly communication0.0000.000
Open science0.0000.000
Research integrity0.0000.000
Insufficient payload (model declined to judge)0.0000.000

Machine scores (provisional)

The two teacher heads of the student model, read on this work. A score orders the frame for review; it never asserts a category, and the validation status ships verbatim with every row.

Baseline scores from an immature model (maturity gate not passed, 7 training rounds). Scores rank; they never assert a category.

Opus teacher head0.020
GPT teacher head0.334
Teacher spread0.314 · how far apart the two teachers sit on this one work
Validation statusscore_only:v0-immature-baseline · verbatim from the scoring run: score_only means the number may rank works, and no category label ships from it

Classification

machine, unvalidated

Machine predicted; a candidate call from one teacher head, not a consensus.

The models applied no category: nothing in the taxonomy fit this work.
Study designBench or experimental
Domainnot available
GenreEmpirical

How this classification was reached, model by model and score by score, is at the end of the page under "How this classification was reached".

Quick stats

Citations0
Published2023
Admission routes1
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