An RB1CC1 Missense Variant in Nova Scotia Duck Tolling Retrievers with Degenerative Encephalopathy
Notice bibliographique
Résumé
A slowly progressive neurological disorder classified as degenerative encephalopathy (DE) occurs in Nova Scotia Duck Tolling Retrievers. The disease is characterized by frequent episodes of pronounced involuntary movements during sleep, cognitive impairment, anxiety, heightened sensitivity to sensory stimuli, and compulsive behaviors. The onset of these signs occurs between 2 months and 5 years of age. Late signs include aggressive behavior, gait abnormalities, and urinary and fecal incontinence. The clinical signs are accompanied by degeneration of the cerebellum, caudate nucleus, and substantia nigra. Next-generation sequencing was used to generate whole-genome sequences from the DNA of affected and unaffected Nova Scotia Duck Tolling Retrievers. The resulting sequences were aligned to the Dog10K_Boxer_Tasha reference genome assembly and the whole genome sequences (WGS) of 334 additonal control canine whole genome sequences generated by the University of Missouri Canine Genetics Laboratory. Analysis of the WGS data identified a missense variant in RB1CC1 exon 22 chromosome 29:4891014, C>T that was uniquely homozygous in the affected dog. This variant predicts a p.G1503R change in the amino acid sequence of RB1CC1. Genotyping of 2,950 Nova Scotia Duck Tolling Retrievers at the variant locus found complete concordance between the disease phenotype and RB1CC1 genotype. RBCC1 is an essential component of a protein complex that mediates the initiation of autophagosome formation. Therefore, it appears likely that the disease results at least in part from impaired autophagy. Consistent with possibility, caudate nucleus neurons of an affected dog were found to contain abnormal lysosomal storage body-like inclusions bodies with heterogenous contents. This disorder could serve as a valuable model to elucidate the mechanisms underlying human diseases associated with impaired autophagy. Identification of the disease-causing DNA sequence variant will enable owners of Nova Scotia Duck Tolling Retrievers to screen their dogs for the RB1CC1 risk variant.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».