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Enregistrement W4407170893 · doi:10.1101/2025.02.05.636639

Heterologous production, purification and crystallization of 24C-sterol methyltransferase from <i>Candida albicans</i>

2025· preprint· en· W4407170893 sur OpenAlexaff
Nokwanda Snethemba Mpontshane, M. Fairhead, Diederik J. Opperman, Rodney Hart, Valmary M. van Breda, F. von Delft, L. Koekemoer, Carmien Tolmie

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSteroid Chemistry and Biochemistry
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCandida albicansHeterologousSterolMicrobiologyChemistryProduction (economics)CrystallizationBiologyBiochemistryCholesterolOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Candida albicans is a critical priority fungal pathogen causing invasive fungal infections with high mortality rates in immunocompromised patients. The increasing fungal infection rate and resistance of fungal pathogens to existing antifungal treatments have emphasized the need for the development of novel antifungal medicine. The ergosterol biosynthesis pathway has been a successful target for antifungal compounds, but many enzymatic steps remain unexplored. 24C-sterol methyltransferase (24C-SMT) catalyzes a critical fungal-specific step in ergosterol biosynthesis. When 24C-SMT is disrupted, fungal pathogens are sensitized to temperature, various inhibitors, and antifungals, and a loss of virulence can be observed. In this study, five 24C-SMT variants with different lengths of N-termini were heterologously produced in Escherichia coli and three were purified to near-homogeneity with immobilized metal-affinity and size-exclusion chromatography. N-terminally truncated C. albicans 24C-SMT was utilized for crystallization trials due to its increased stability and higher purity compared to the full-length protein. 24C-SMT crystals were obtained in the presence of Sadenosyl-homocysteine, but diffracted to low resolution. Therefore, we established a starting point for 24C-SMT crystallization by providing an optimized protocol for heterologous 24C-SMT production, purification and initial crystallization conditions, which could be used for further downstream crystallographic studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,207
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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