MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4407199190 · doi:10.1021/acs.langmuir.4c03449

Interactions between DNA and a Pyrene-Labeled Surfactant Probed by Pyrene Excimer Formation, Transmission Electron Microscopy, and Dynamic Light Scattering

2025· article· en· W4407199190 sur OpenAlexafffund
Jean Duhamel

Notice bibliographique

RevueLangmuir · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPyreneExcimerTransmission electron microscopyDynamic light scatteringChemistryPhotochemistryScatteringChemical physicsPulmonary surfactantElectronDNAFluorescenceMaterials scienceMolecular physicsOpticsNanotechnologyNanoparticlePhysicsOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The interactions between calf thymus DNA and a pyrene-labeled gemini surfactant termed PyO-3–12 were investigated by using dynamic light scattering (DLS), transmission electron microscopy (TEM), and pyrene excimer formation (PEF) between an excited and a ground-state pyrene. PyO-3–12 was prepared with two dimethylammonium bromide headgroups linked with a propyl spacer, with one ammonium bearing a dodecyl tail and the other bearing a 1-pyrenemethoxyhexyl pendent. The size and electrostatic properties of the colloidal species were characterized by DLS, and TEM was used to describe the overall dimensions and morphologies of the aggregates. PEF enabled the study of PyO-3–12 at the molecular level. The association of PyO-3–12 and DNA was studied in detail for two specific PyO-3–12 concentrations of 16 and 56 μM using a (∓) ratio equal to the [DNA]/[PyO-3–12] ratio with [DNA] expressed in terms of DNA base pairs, yielding a (∓) ratio ranging from 0.1 to 10. An increase in PyO-3–12 association upon adding DNA was detected through an increase in PEF. Analysis of the fluorescence decays indicated a progressive binding of PyO-3–12 to DNA until the equicharge point was reached after which all PyO-3–12 surfactants were bound to DNA. The formation of large colloidal aggregates was observed by DLS, which showed a spike in the hydrodynamic diameter ( D h ) as the (∓) ratio approached unity. Analysis of the fluorescence spectra suggested that the excited pyrenyl labels experienced a more hydrophobic environment for the lipoplexes generated by the 56 μM PyO-3–12 solutions, which appeared smaller and more globular in the TEM images than the lipoplexes obtained with the lower 16 μM PyO-3–12 concentration. Together, these experiments suggest that the concentrations of the cationic gemini surfactants and DNA are important parameters for the morphology of lipoplexes with possible implications for their transfection efficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueLangmuirMême sujetRNA Interference and Gene DeliveryTravaux en français237 207