Distinct roles of Constitutive Photomorphogenesis Protein 1 homolog (COP1) in human hepatocyte models
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Constitutive Photomorphogenesis Protein 1 homolog (COP1) is a conserved E3 ligase with key roles in several biological systems. Prior work in hepatocyte-derived tumors categorized COP1 as an oncogene, but its role in untransformed hepatocytes remains largely unexplored. Here, we have investigated the role of COP1 in primary human hepatocytes and two transformed hepatocyte models, HepG2 and HuH-7 cells. Methods: The role of COP1 was tested by silencing and transduction experiments in HepG2, HuH-7, and primary human hepatocytes. Transcription array data of COP1-suppressed cells were generated and analyzed using clustering analyses. Cellular impacts were examined by proliferation assays, qRT-PCR, western blotting, reporter assays, and APOB enzyme-linked immunosorbent assays. Results and Discussion: COP1 suppression had no noticeable impact on HepG2 and HuH-7 proliferation and was associated with contrasting rather than congruent transcriptome changes. Transcriptomic changes were consistent with perturbed metabolism in primary hepatocytes and HepG2 cells and impaired cell cycle regulation in HuH-7 cells. In HepG2 and primary hepatocytes but not in HuH-7 cells, COP1 suppression reduced the expression of important hepatic regulators and markers. COP1 downregulation reduced hepatic nuclear factor-4 alpha (HNF4A) abundance and function, as assessed by a lower abundance of key HNF4A targets, reduced APOB secretion, and reporter assays. HNF4A function could be restored by introducing a siRNA-resistant COP1 transgene, whereas HNF4A restoration partially rescued COP1 silencing in HepG2 cells. Our results identify and detail a pivotal regulatory role of COP1 in hepatocytes, in part through HNF4A.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».