Metabolic Profiling of Meningioma Reveals Novel Subgroup-Specific Biologic Insights and Outcome Dependencies
Notice bibliographique
Résumé
Background: Prior studies have elucidated the presence of four consensus molecular groups (MGs) of meningioma, with unique underlying biology and outcomes. The hyperactivation of metabolic pathways may be associated with tumor growth, and therefore poor outcomes, in the so-called hypermetabolic (MG3) tumors, and there is a need to better understand the metabolic landscape of these tumors. This study is the first to study the global metabolon of meningioma in the context of modern molecular subgroups. Methods: Untargeted metabolic profiling (Metabolon Inc.) was performed on 53 meningiomas representing each molecular group and WHO grade. Prognostic biochemicals were identified using Cox regression and further investigated using RNA and protein-based pathway analyses. A larger cohort with available RNA sequencing ( n = 121) was used to further explore the prognostic influence of relevant pathways, and biochemicals of interest were validated on a subset of these samples ( n = 35) using targeted high performance liquid chromatography-mass spectrometry (HPLC-MS/MS). Results: Global metabolic profiling identified 560 unique biochemicals for downstream analysis. The abundance of N6-trimethyllysine was associated with significantly earlier time to recurrence highly prognostic on our whole cohort (HR [95%CI] = 3.18 [1.45–26.23], p = 0.004) and within hypermetabolic (MG3) tumors (HR [95% CI] = 6.73 [1.72–6.97], p = 0.006); pyruvate was associated with worse outcomes in proliferative (MG4) tumors specifically (HR [95%CI] = 5.65 [1.073–29.71], p = 0.041). Analysis of implicated gene pathways demonstrated that upregulation of the oxidative phosphorylation pathway portends worse outcomes in the hypermetabolic subgroup but, surprisingly, better outcomes in the proliferative subgroup. By contrast, upregulated lactate transporters were associated with worse outcomes in proliferative, but not hypermetabolic, meningiomas. Conclusion: This is the first study to demonstrate a subgroup-specific prognostic role of N6-trimethyllysine and pyruvate in meningioma, offering increasingly granular outcome predictions using a widely accessible technique (HPLC-MS/MS). In addition, we demonstrated key differences in energy utilization between hypermetabolic and proliferative tumors, both of which are associated with poor outcomes, suggesting fundamental differences in preferred energy utilization and reinforcing a need for subgroup-specific therapies. Publication History Article published online: 07 February 2025 © 2025. Thieme. All rights reserved. Georg Thieme Verlag KG Oswald-Hesse-Straße 50, 70469 Stuttgart, Germany
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».