ABA-regulated JAZ1 suppresses phytoalexin biosynthesis by binding GmNAC42-1 in soybean
Notice bibliographique
Résumé
Phytoalexins are plant defense metabolites whose biosynthesis remains suppressed until elicited by a pathogen or stress, yet the mechanism of their suppression has remained elusive. The transcription factor GmNAC42–1 directly activates glyceollin phytoalexin biosynthesis in soybean, but its overexpression without elicitation fails to induce glyceollin biosynthetic genes, suggesting suppression by a negative regulator. JAZ1 proteins act as negative regulators in the canonical jasmonic acid (JA) signaling pathway. JAZ protein degradation and JAZ gene transcription comprise antagonistic mechanisms that activate and suppress JA signaling. Here, RNA-seq analysis revealed that abscisic acid (ABA) signaling and GmJAZ1 genes are inversely regulated compared to glyceollin biosynthesis at late timepoints following elicitation, identifying them as potential long-term negative regulators. Long-term ABA treatment increased GmJAZ1 transcript levels, whereas an ABA biosynthesis inhibitor completely suppressed their upregulation by dehydration. Opposite patterns were observed for glyceollin biosynthesis. RNAi silencing of GmJAZ1s prevented the suppression of glyceollin biosynthesis by long-term dehydration stress and derepressed glyceollin synthesis in non-elicited tissues. Overexpressing GmJAZ1–9 in hairy roots elicited with Phytophthora sojae wall glucan elicitor partially suppressed short-term elicitation of glyceollin biosynthesis. The GmJAZ1–9 protein interacted with GmNAC42–1, inhibiting its transactivation and DNA-binding activities. JAZ1 silencing in Arabidopsis and grapevine derepresses phytoalexin biosynthesis. While the short-term response to pathogen elicitation includes a reduction in ABA levels and JA-mediated JAZ protein degradation, our work demonstrates a subsequent long-term response where ABA upregulates JAZ1 transcript levels by an unknown mechanism and JAZ1 proteins bind NAC42-type transcriptional activators to directly inhibit their transactivation of phytoalexin biosynthesis. • GmJAZ1 proteins suppress glyceollin biosynthesis by binding and inhibiting the NAC-family transcription factor GmNAC42–1. • Silencing GmJAZ1 genes derepresses glyceollin biosynthesis in non-elicited soybean. • The JAZ1-NAC42 protein-protein interaction is conserved among soybean, Arabidopsis , and grapevine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».