A73 MICROBIAL CONTRIBUTION TO THE RISK OF FUTURE CROHN’S DISEASE: STRATIFICATION BY SUBCLINICAL INFLAMMATION LEVELS MEASURED BY FECAL CALPROTECTIN
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Crohn’s disease (CD) prevalence is rising globally, but its pathogenesis remains unclear. Our group found specific microbes predict future CD risk in healthy first-degree relatives (FDR), whereas high fecal calprotectin (FCP) level (>100ug/g) was also significantly associated with a 6-fold higher risk of CD onset. However, the influence of FCP on how microbial communities contribute to CD risk remains unknown. Understanding microbial interactions with gut inflammation may offer insights into CD onset. Aims This study investigates how microbial composition and function contribute to CD risk in healthy in association with their baseline FCP levels. Methods Healthy FDRs from the CCC-GEM Project were followed for CD onset. Using baseline stool samples, microbial compositions were analyzed with 16S rRNA sequencing and functional predictions with PICRUSt2. Cox PH models assessed relationships between microbiome composition, functional pathways, and CD risk stratified by high or low levels of subclinical inflammation, defined by FCP with a cut-off of 100 ug/g (FCP>100 and FCP<100, respectively). q<0.1 was considered statistically significant. Results We followed 3430 FDRs for a median of 7.7 years, among which 76 developed CD. In the subgroup with FCP>100 a higher abundance of Ruminococcus torques group, an undefined Ruminococcus genus, and Romboutsia were significantly associated with an increased risk of CD. In contrast, Oscillospiraceae family was consistently associated with a lower CD risk in both FCP>100 and FCP<100 subgroups. Microbial functional pathways analysis revealed that peptidoglycan-N-acetylmuramic acid deacetylase, 4’-phosphopantetheinyl transferase, and iron(III) transport system ATP-binding protein were consistently associated with a decreased risk of CD in both FCP>100 and FCP<100 subgroups. However, pathways including Flagellar motor switch protein FliN and Carboxynorspermidine decarboxylase were associated with increased risk of CD, but only in the FCP>100 subgroup. In contrast, geranylgeranyl diphosphate synthase and heat shock protein HspR were associated with increased CD risk in the FCP<100 subgroup. Conclusions The microbial contribution to CD risk in healthy FDRs may vary depending on baseline FCP levels. Specific taxa and functional pathways were identified as contributors to CD risk in FDRs in the presence or absence of intestinal inflammation. Notably, the Oscillospiraceae family was consistently associated with a decreased risk of CD, highlighting its potential as a therapeutic target in the pre-clinical phase of CD. Funding Agencies None
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».