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Enregistrement W4407285601 · doi:10.1093/jcag/gwae059.209

A209 EVALUATION OF THE ROLE OF DUSP1 AND DUSP16 GENES IN THE REGULATION OF INTESTINAL EPITHELIAL FONCTIONS

2025· article· en· W4407285601 sur OpenAlexaff
Richard C. Huard, Jessy Carol Ntunzwenimana, Céline M. Lévesque, Marie-Ève Rivard, Philippe Goyette, John D. Rioux

Notice bibliographique

RevueJournal of the Canadian Association of Gastroenterology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDigestive system and related health
Établissements canadiensMontreal Heart InstituteUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneBiologyCell biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Inflammatory bowel disease (IBD) is associated with inflammation of the gastrointestinal tract, resulting from a dysregulation of the immune response to microbes in the intestinal lumen. Dr. Rioux’s laboratory has identified over 200 genomic regions associated with IBD. However, the challenge lies in identifying the causal gene in many of these. To address this problem, our laboratory completed a transcriptomic screen following overexpression of IBD-associated genes in intestinal epithelial cells. This study demonstrates that DUSP1 and DUSP16, two phosphatases targeting MAP Kinases (MAPKs), regulate the expression of several shared genes involved in intestinal differentiation and homeostasis. Aims Our research hypothesis is that the DUSP1 and DUSP16 genes participate in the regulation of biological processes involved in IBD and critical for the integrity of the intestinal barrier. More specifically, we want to determine how a reduction in DUSP1 and DUSP16 affects the biological pathways leading to the regulation of epithelial junction integrity, as well as inflammasome activation and IL-18 secretion. Methods In this project, we studied Caco-2 cells expressing DUSP1 or DUSP16 knockdown and their effect on intestinal epithelial cell functions. Among other things, we observed the cells’ ability to form a tight monolayer in 2D and spheroids in 3D. We also analyzed by Western blotting the impact of knockdowns on inflammasome formation and normal activity. Results Our results show that Dusp1 and DUSP16 knockdowns disrupt the ability of Caco-2 cells to form a tight monolayer and to form spheroids. In addition, our inflammasome analysis shows that KDs deregulate inflammasome activity. Conclusions These results demonstrate that decreased expression of the DUSP1 and DUSP16 genes impacts several functions essential to the maintenance of intestinal epithelial cell homeostasis, such as intestinal barrier integrity and inflammasome activation. Funding Agencies CIHRNIH

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,077
Score d'incertitude au seuil0,938

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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