Development of PowerMag System II for Isolation of Circulating Tumor Cells with Improved Purity
Notice bibliographique
Résumé
Background/Objectives: The PowerMag system (PM) is a platform for the isolation of circulating tumor cells (CTCs) by the depletion of CD45+-leukocytes. However, an EpCAM−CD45− cell population is present in large numbers in the cell filtrates collected by PM. This lowers the purity of the CTCs and negatively impacts their molecular characterization. The aims of this study are to characterize the cellular properties of the EpCAM−CD45− cells and to upgrade the system to improve CTC purity. Methods: A real-time RT-PCR assay, Liu’s stain analysis, and Annexin V (AnxV) binding assay were used to define the cellular properties of the EpCAM−CD45− cells. An upgraded system was developed to remove the EpCAM−CD45− cells and improve the CTC purity. Clinical blood samples were used to evaluate the performance of the system. Results: The EpCAM−CD45− cells were defined as apoptotic cells, which displayed apoptotic body-like morphology and elicited AnxV binding activity. AnxV beads developed in-house can effectively bind and remove EpCAM−CD45− cells from the cell filtrates. An improved generation of a CTCs isolation platform, designated as PM II, was developed by integration of AnxV beads into the workflow to remove the apoptotic cells. PM II recovered CTCs with improved CTC purity by effective removal of the background apoptotic cells. The improved performance of PM II allowed for direct profiling of cancer-related gene mutations by next-generation sequencing without cell picking and further purification. Conclusions: PM II holds great promise as a platform for isolating CTCs with improved purity and for exploring its application in cancer diagnosis and monitoring in a clinical setting.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».