MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4407450550 · doi:10.1101/2025.02.13.638192

<i>Dehalobacter</i> dechlorinates dichloroanilines and contributes to the natural attenuation of dichloronitrobenzenes at a complex industrial site

2025· preprint· en· W4407450550 sur OpenAlexaff
Sofia Pimentel Araújo, Line Lomheim, E. Erin Mack, Jim C. Spain, Sávia Gavazza, Elizabeth A. Edwards

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial bioremediation and biosurfactants
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesFundação de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco
Mots-clésMicrocosmBiotransformationReductive dechlorinationBioremediationEnvironmental chemistryChemistryBiodegradationBiologyEcologyContaminationBiochemistryOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The potential for bioremediation of dichloroanilines (2,3- and 3,4-DCA) and dichloronitrobenzenes (3,4-, 2,5- and 2,3-DCNB) was investigated using inocula from an industrial site in northeast of Brazil. Anaerobic biotransformation of these chlorinated compounds was observed in microcosms simulating site conditions, particularly when electron donor was added. To disentangle specific transformation reactions, sub-cultures from active anaerobic microcosms were enriched with individual DCA or DCNB isomers. In these single-compound enrichment cultures, DCNB isomers were reduced to the corresponding DCA. Each DCA isomer was stoichiometrically dechlorinated to the corresponding monochloroaniline (CA) isomers. Further dechlorination of CA to aniline was noted. The reduction of DCNB to DCA was sustained by known fermenters and possibly Desulfitobacterium , while Dehalobacter was clearly responsible for dechlorination of DCAs. These findings helped to attribute function to microbial community data retrieved from field samples to inform the conceptual site model and enable identification of bioactive zones and rate-limiting conditions at a complex site. More generally, these data broaden the understanding of the metabolic repertoire of Dehalobacter and provide a model for incorporating microbial community data into site remediation efforts. Abstract Figure Graphical Abstract Short synopsis statement A diverse microbial community contributes to natural attenuation at a complex contaminated site. Notably, dichloroanilines produced by biologically-mediated nitroreduction of dichloronitrobenzenes were dechlorinated by Dehalobacter .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,028

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetMicrobial bioremediation and biosurfactants→Travaux en français237 207→