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Enregistrement W4407538032 · doi:10.1038/s41467-025-56776-z

Characterising the asynchronous resurgence of common respiratory viruses following the COVID-19 pandemic

2025· review· en· W4407538032 sur OpenAlexaff
Chenkai Zhao, Tiantian Zhang, Ling Guo, Shiqi Sun, Yumeng Miao, Chee Fu Yung, Jane Tomlinson, K. A. Stolyarov, Zakhar Shchomak, Yong Poovorawan, D. James Nokes, Carmen Muñoz‐Almagro, Michal Mandelboim, James W. Keck, Joanne M. Langley, Terho Heikkinen, Jikui Deng, Philippe Colson, Giorgi Chakhunashvili, Mauricio T. Caballero, Louis Bont, Daniel R. Feikin, Harish Nair, Xin Wang, You Li, Yara‐Natalie Abo, Andrew J. Daley, Gregory Waller, Daria Danilenko, Andrey B. Komissarov, Teresa Bandeira, Nongruthai Suntronwong, Siripat Pasittungkul, Esther Nyadzua Katama, Cristian Launes, Quique Bassat, Ital Nemet, Jennifer Dobson, Jiajia Bi, Guangcheng Deng, Céline Boschi, Bernard La Scola, Didier Raoult, Irakli Karseladze, Khatuna Zakhashvili, Olgha Tarkhan‐Mouravi, Julia Dvorkin, Marie Billard

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory viral infections research
Établissements canadiensCentre for Global Health ResearchNova Scotia Health AuthorityDalhousie University
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of ChinaWorld Health Organization
Mots-clésHuman metapneumovirusRhinovirusVirologyPandemicVirusMetapneumovirusBiologyAsynchrony (computer programming)CoronavirusInfluenza A virusRespiratory systemCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Respiratory tract infectionsMedicineAsynchronous communication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The COVID-19 pandemic and relevant non-pharmaceutical interventions (NPIs) interrupted the circulation of common respiratory viruses. These viruses demonstrated an unprecedented asynchronous resurgence as NPIs were relaxed. We compiled a global dataset from a systematic review, online surveillance reports and unpublished data from Respiratory Virus Global Epidemiology Network, encompassing 92 sites. We compared the resurgence timings of respiratory viruses within each site and synthesised differences in timings across sites, using a generalised linear mixed-effects model. We revealed a distinct sequential timing in the first post-pandemic resurgence: rhinovirus resurged the earliest, followed by seasonal coronavirus, parainfluenza virus, respiratory syncytial virus, adenovirus, metapneumovirus and influenza A virus, with influenza B virus exhibiting the latest resurgence. Similar sequential timing was observed in the second resurgence except influenza A virus caught up with metapneumovirus. The consistent asynchrony across geographical regions suggests that virus-specific characteristics, rather than location-specific factors, determining the relative timing of resurgence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,019
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,030

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,019
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,004
Bibliométrie0,0050,005
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,269
Tête enseignante GPT0,528
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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