Elevated Plasma Complement Factors in <i>CRB1</i>-Associated Inherited Retinal Dystrophies
Notice bibliographique
Résumé
Purpose: To determine the profile of inflammation-related proteins and complement system factors in the plasma of CRB1-associated inherited retinal dystrophies (CRB1-IRDs). Methods: We used the Olink Explore 384 Inflammation II panel for targeted proteomics in 30 cases and 29 controls (cohort I) to identify immune pathways involved in CRB1-IRDs. Genotyping was performed in cohort I and a second cohort of 123 patients from 14 countries and 1292 controls (cohort II). Results: A significant shift in complement cascade factors was observed in plasma proteomes of CRB1-IRD patients (enrichment for complement cascade, Padj = 3.03 × 10-15). We detected higher plasma levels of complement factor I and complement factor H [CFH] (q = 0.008 and q = 0.046, respectively, adjusted for age and sex), inhibitors of complement component 3 (C3), which correlated significantly (Pearson's coefficient >0.6) with elevated levels of C3 (q = 0.064). The CRB1 missense variants frequently found in patients showed a strong linkage disequilibrium with the common CFH variant rs7535263 (D' = 0.97 for p.(Cys948Tyr); D' = 1.0 for p.(Arg764Cys)), known to be linked with altered plasma CFH-related protein levels. Correction for the CFH genotype revealed significantly elevated plasma levels of CFH-related 2 (CFHR2) in CRB1-IRD patients (q = 0.041). Conclusions: CRB1-IRDs are characterized by changes in plasma levels of complement factors and proteins of the innate immune system, and linkage between CRB1 and CFH genes implicates functional variants of the CFH-CFHR locus with specific pathogenic variants of CRB1.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».