Transcriptome analysis of interna rootlets of the rhizocephalan Parasacculina sinensis reveals potential mechanisms of parasite host control
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The endoparasitic rhizocephalan Parasacculina sinensis has a radically simplified morphology and primarily infests decapods crustaceans. Rhizocephalan barnacles usually absorb nutrients from the host through a complex rootlet system (the interna), and also change the morphology, physiology and behavior of their hosts. However, little is known about the transcriptomic landscape, ultrastructural details and gene expression of the interna rootlets in the group. In this study, we investigated the structural and molecular signatures of the interna of P. sinensis by using detailed histological staining and transcriptomic analyses. RESULTS: The interconnected F-actin nodal network, lipid droplets, and nucleus of interna rootlets were visualized using fluorescence straining. We successfully obtained a clean transcriptome of P. sinensis and conducted functional analyses of interna embedded within host hepatopancreas, claw muscle, and eyestalk. The gene ontology (GO) terms related to translation, metabolic process, biosynthetic process, cellular process were highly expressed in the top 10% transcripts from the interna. The GO category of shared differential expression of genes (DEGs) among internae was related to embryonic development. The Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway neuroactive ligand-receptor interaction and the GO term neurotransmitter transporter activity were identified in the shared DEGs among internae. The interna entangled within host hepatopancreas, eyestalk and claw muscle fibers had similarities and differences in the functional biology. Additionally, the interna specific candidate genes probably involved in host immune, lipid metabolism, molting and growth were identified. CONCLUSIONS: Our study demonstrates an in-depth function of interna rootlets of P. sinensis and reveals potential mechanisms of parasite host control. This study provides novel information to further investigate the evolutionary drivers of parasitism in barnacles.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».