Analysis of the Allelic Structure of Photoperiodism Genes E1–E4 in Soybean Collections and Its Impact on the Timing and Duration of Flowering under the Growing Conditions of the Omsk Oblast
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Soybean is a strategically important agricultural crop that serves as a source of vegetable fat and protein. The processed products derived from soybean are utilized in the food, livestock, and various other industries. To expand soybean production in Russia, it is essential to develop varieties that are adapted to the agroclimatic conditions of northern latitudes, including Western Siberia, which is characterized by a relatively short growing season and long daylight period. To effectively develop adaptive early-flowering and early-maturing soybean varieties, it is essential to evaluate the impact of the E1, E2, E3, and E4 genes on the photoperiodic response of soybean and their influence on plant development timing under local conditions. A total of 102 accessions from the Omsk Agricultural Scientific Center’s collection were analyzed, including original varieties from the center, varieties from other domestic breeding centers, and foreign varieties and breeding accessions from Poland, Sweden, Belarus, Ukraine, Canada, and other countries. Data on flowering dates were collected from a field experiment conducted in the Omsk oblast between 2021 and 2023. Genotyping was performed using both classical PCR-based markers and next-generation markers based on competitive allele-specific PCR. The analysis revealed that the recessive alleles of the E loci, which produce a photoperiodically neutral phenotype (e1-as, e1-fs, e2-ns, e3-tr, e3-fs, e4-kes, e4-kes+e4-SORE-1), are predominant in the collection. Furthermore, it was determined that the E2 and E4 loci exert the most significant influence on the full flowering date, while the E3 locus has the greatest effect on the end date of flowering and the overall duration of flowering. The findings can be utilized in marker-assisted selection to develop early-flowering varieties of the Siberian ecotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».