MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4407946625 · doi:10.1212/nxg.0000000000200251

Association of <i>DMD</i> Gene Variant Classes With Motor Outcomes in a Drug Registration Clinical Trial Setting

2025· article· en· W4407946625 sur OpenAlexaff
Yuan Fang, Utkarsh J. Dang, Katherine I. Illei, Paula R. Clemens, Eric P. Hoffman

Notice bibliographique

RevueNeurology Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDuchenne muscular dystrophyDystrophinMedicineClinical trialNull alleleBiologyGeneBioinformaticsGeneticsInternal medicineAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background and Objectives: gene, leading to the loss of dystrophin. Clinical variability in DMD can complicate interpretation of interventional data in clinical trials. One source of clinical variability is allelic heterogeneity (different pathogenic variants with different effects on dystrophin protein expression). We sought to determine whether gene variant classes in clinical trial participants potentially affect clinical trial data interpretation. Methods: We analyzed 186 vamorolone trial participants with DMD (VBP15-002/003; VBP15-004) who were 4 to <7 years old and steroid-naïve at baseline. We stratified participants into gene variant classes by either variant location in the gene affecting different gene promoters (5' [Dp427-only] vs 3' [Dp427+other isoforms]) or residual dystrophin levels (null vs possible non-null [5' gene variants, exon 44 skippable, splice site]). We evaluated associations with baseline motor outcomes and treatment response (prednisone and vamorolone). Results: Participants with variants in ex63 and downstream (null for Dp427+Dp140+Dp71 protein isoforms) showed poorer baseline motor outcomes for time to stand from supine velocity than those with variants in ex1-44 (Dp427 only). No significant baseline differences were found between likely null and possible non-null variants. Participants with only Dp427 involvement showed significantly better treatment response for the 6-minute walk distance. Most of the comparisons of baseline motor function and treatment response were similar between variant classes. Discussion: The large variation in baseline motor function in young, steroid-naïve patients with DMD is only minimally explained by different gene variant classes. While there is strong literature support for 3' variants leading to a more severe motor and cognitive DMD phenotype, we found this variant class under-represented in our clinical trials. This suggests that they may fail inclusion criteria (failure to follow commands; poor motor function). Subgroup analyses in DMD clinical trials at a young age range based on gene variant class may not reveal significant differences and would be relatively noninformative.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,105
Score d'incertitude au seuil0,486

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNeurology GeneticsMême sujetMuscle Physiology and DisordersTravaux en français237 207