Genetically distinct Hajj and South American-related strains of serogroup W Neisseria meningitidis causing invasive meningococcal disease in Ontario, Canada, January 1, 2015 to June 30, 2024
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To characterize the recent trends in serogroup W isolates from invasive meningococcal disease (IMD) cases (MenW) in Ontario, Canada since 2015. METHODS: IMD case isolates in Ontario between January 1, 2015 and June 30, 2024 were examined by phenotypic and genetic methods for possession of vaccine antigen genes and clonal characteristics. MenW ST-11 clonal complex (CC) strains were compared against global MenW isolates by core-genome multi-locus sequence typing (cgMLST). RESULTS: The percentage of culture-confirmed IMD caused by MenW in Ontario increased from 10 % in 2015-40.9 % in the first half of 2024, consisting entirely of strains belonging to the ST-11 CC. cgMLST comparison of the Ontario invasive MenW isolates versus international MenW ST-11CC strains showed that the Ontario isolates were related to those found globally, with a recent cluster of eight cases from one city due to a strain highly related to international Umrah outbreak strains. Most MenW IMD cases (60 %) occurred in individuals older than 40 years of age and the majority (83.3 %) predicted to express antigens covered by the 4CMenB vaccine. CONCLUSIONS: Multiple different introductions of international MenW strains likely accounted for the recent shift towards invasive MenW disease in Ontario.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».