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Enregistrement W4408077309 · doi:10.1101/2025.02.25.640258

Thiazole substitution of a labile amide bond - a new option towards stable pantothenamide-mimics

2025· preprint· en· W4408077309 sur OpenAlexaff
X. S. Liu, Annica Chu, Mina Nekouei, Chunling Blue Lan, Karine Auclair, Kevin J. Saliba

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueChemical Synthesis and Analysis
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSubstitution (logic)BondAmideThiazoleChemistryPeptide bondEconomicsStereochemistryComputer scienceOrganic chemistryFinanceAmino acidBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT The emergence and spread of artemisinin-resistant, malaria-causing P. falciparum provide the impetus for the development of novel antimalarials. Pantothenamides are potent inhibitors of malaria parasite proliferation, however their clinical use is hindered by pantetheinase-mediated degradation in human serum. Here we report the synthesis and biological activity of a series of pantothenamide-mimics in which the labile amide bond is replaced by a thiazole ring with various orientations. Out of 23 novel compounds generated and tested in the presence of pantetheinase, several display sub-micromolar antiplasmodial activity in vitro . A selection of compounds was studied in more detail and CoA biosynthesis and/or utilisation pathways were confirmed to be the target. Toxicity to human cells was not observed. Kinetic studies identified the selected compounds as substrates of the Hs PanK3 enzyme, but with much lower affinity compared to that of the natural substrate pantothenate. The most potent thiazole-bearing antiplasmodial compound was found to bind to Pf PanK with a 120-fold higher affinity compared to Hs PanK, highlighting excellent selectivity, not only against the key first enzyme in the CoA biosynthesis pathway, but also at the whole-cell level. In conclusion, thiazole substitution of the labile amide bond represents a promising avenue for the development of antimalarial pantothenamide-mimics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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