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Enregistrement W4408095814 · doi:10.3389/fcell.2025.1523382

Proteasome dynamics in response to metabolic changes

2025· review· en· W4408095814 sur OpenAlexaff
Cordula Enenkel, Oliver P. Ernst

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Cell and Developmental Biology · 2025
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteasomeCell biologyUbiquitinCytoplasmOrganelleProtein degradationBiologyBiochemistryChemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Proteasomes, essential protease complexes in protein homeostasis, adapt to metabolic changes through intracellular movements. As the executive arm of the ubiquitin-proteasome system, they selectively degrade poly-ubiquitinated proteins in an ATP-dependent process. The primary proteasome configuration involved in this degradation is the 26S proteasome, which is composed of a proteolytically active core particle flanked by two regulatory particles. In metabolically active cells, such as proliferating yeast and mammalian cancer cells, 26S proteasomes are predominantly nuclear and actively engaged in protein degradation. However, during nutrient deprivation or stress-induced quiescence, proteasome localization changes. In quiescent yeast, proteasomes initially accumulate at the nuclear envelope. During prolonged quiescence with decreased ATP levels, proteasomes exit the nucleus and are sequestered into cytoplasmic membraneless organelles, so-called proteasome storage granules (PSGs). In mammalian cells, starvation and stress trigger formation of membraneless organelles containing proteasomes and poly-ubiquitinated substrates. The proteasome condensates are motile, reversible, and contribute to stress resistance and improved fitness during aging. Proteasome condensation may involve liquid-liquid phase separation, a mechanism underlying the assembly of membraneless organelles.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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