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Enregistrement W4408134283 · doi:10.4103/jcls.jcls_128_24

Exploring the potential of Cucumis melo phytoconstituents for treating diabetic neuropathy using in silico molecular docking and simulation: An experimental study

2025· article· en· W4408134283 sur OpenAlexaff
Fahaad Alenazi, Sadaf Anwar, Halima Mustafa Elagib, Malik Asif Hussain, Tulika Bhardwaj, Mohd Adnan Kausar

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueComputational Drug Discovery Methods
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIn silicoCucumisDocking (animal)Computational biologyMedicineChemistryBiologyBotanyBiochemistryVeterinary medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Diabetic nephropathy (DN) is a serious kidney disease that damages and declines kidney function and is associated with long-term diabetes. It is a major global cause of chronic kidney disease that is impacted by oxidative stress, inflammation, high blood sugar, and genetics. Key targets include the renin-angiotensin-aldosterone system and the transforming growth factor-beta (TGF-b) pathway. To lessen inflammatory reactions, prevent oxidative damage, and slow the advancement of DN, researchers are investigating Sodium-Glucose Co-Transporter 2 (SGLT2) inhibitors, antioxidants, and inflammation modulators. TGF-β1, a cytokine, is crucial in DN, causing fibrosis, inflammation, and extracellular matrix accumulation. This study aims to investigate the therapeutic potential of phytoconstituents of Cucumis melo seeds in managing DN. Methods The study assessed molecular docking (MD) of target protein structure (TGF-β1) with potential 17 phytocompounds, assessing their lipophilicity and polarity in the brain or intestinal tract. Result In silico virtual screening, drug-likeliness analysis, and BOILED-Egg plot analysis infer two potential chemical leads, namely alpha-amyrin and campesterol with a binding energy of −10.13 kcal/mol and −9.18 kcal/mol, respectively, for drug discovery against DN. Further, MD simulation studies validate the docked complexes’ stability over time. Conclusion This research indicates that additional analysis is necessary to validate the inhibitory potential of alpha-amyrin and campesterol, utilizing bench-top methodologies to determine the most effective treatment plan for DN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,100
Score d'incertitude au seuil0,224

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,230
Tête enseignante GPT0,497
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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