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Enregistrement W4408142346 · doi:10.1093/nar/gkaf105

Packaged delivery of CRISPR–Cas9 ribonucleoproteins accelerates genome editing

2025· article· en· W4408142346 sur OpenAlexfundno aff
Hannah Karp, Madeline Zoltek, Kevin Wasko, Angel Menendez Vazquez, Jinna Brim, Wayne Ngo, Alanna Schepartz, Jennifer A. Doudna

Notice bibliographique

RevueNucleic Acids Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCRISPR and Genetic Engineering
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of General Medical SciencesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaEmerson CollectiveHoward Hughes Medical InstituteNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésBiologyCRISPRGenome editingRibonucleoproteinCas9GeneticsComputational biologyGuide RNAGenomeGeneRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Effective genome editing requires a sufficient dose of CRISPR-Cas9 ribonucleoproteins (RNPs) to enter the target cell while minimizing immune responses, off-target editing, and cytotoxicity. Clinical use of Cas9 RNPs currently entails electroporation into cells ex vivo, but no systematic comparison of this method to packaged RNP delivery has been made. Here we compared two delivery strategies, electroporation and enveloped delivery vehicles (EDVs), to investigate the Cas9 dosage requirements for genome editing. Using fluorescence correlation spectroscopy, we determined that >1300 Cas9 RNPs per nucleus are typically required for productive genome editing. EDV-mediated editing was >30-fold more efficient than electroporation, and editing occurs at least 2-fold faster for EDV delivery at comparable total Cas9 RNP doses. We hypothesize that differences in efficacy between these methods result in part from the increased duration of RNP nuclear residence resulting from EDV delivery. Our results directly compare RNP delivery strategies, showing that packaged delivery could dramatically reduce the amount of CRISPR-Cas9 RNPs required for experimental or clinical genome editing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,602

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,365
Écart entre enseignants0,340 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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