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Enregistrement W4408148841 · doi:10.1158/1055-9965.epi-24-1442

Association of Inherited Genetic Variants with Multiple Primary Melanoma

2025· article· en· W4408148841 sur OpenAlexaff
David C. Gibbs, Brittany M. Small, Isidora Autuori, Siok Leong, Emily Ali, Jessica Kenney, Li Luo, Peter A. Kanetsky, Klaus J. Busam, Anne Ε. Cust, Hoda Anton‐Culver, Richard P. Gallagher, Roberto Zanetti, Stefano Rosso, Lidia Sacchetto, Sharon N. Edmiston, Kathleen Conway, David W. Ollila, Colin B. Begg, Marianne Berwick, Irene Orlow, Nancy E. Thomas

Notice bibliographique

RevueCancer Epidemiology Biomarkers & Prevention · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous Melanoma Detection and Management
Établissements canadiensCanadian Centre for Applied Research in Cancer Control
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesMelanoma Centre of Research ExcellenceNational Cancer Institute
Mots-clésGenome-wide association studySingle-nucleotide polymorphismOdds ratioMinor allele frequencyGenetic associationMedicineAllelePopulationOncologyGeneticsConfidence intervalInternal medicineBiologyGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Recent genome-wide association studies (GWAS) have identified new susceptibility loci for melanoma, but their associations with multiple primary melanoma (MPM) are unclear. METHODS: We investigated the associations of 69 SNPs in 39 GWAS-identified loci with odds of MPM relative to single primary melanoma in the international, population-based Genes, Environment, and Melanoma study. Per-minor-allele ORs and 95% confidence intervals (CI) for individuals with MPM "cases" (n = 1,205) relative to single primary melanoma "controls" (n = 2,458) were estimated using multivariable logistic regression, and polygenic risk scores (PRS) were calculated and weighted based on a 2020 GWAS meta-analysis (57 of the 68 independent GWAS SNPs available). RESULTS: Thirteen SNPs in 11 gene regions (PARP1, CYP1B1/RMDN3, TERT, RAPGEF5, TYRP1, MTAP, CDKN2A/CDKN2B, KLF4, TYR, SOX6, and ASIP) were statistically significantly associated (P < 0.05) with MPM adjusting for age, sex, age-by-sex interaction, and study center. The highest versus lowest PRS quintile was associated with a 2.81-fold higher odds of MPM (95% CI, 2.10-3.78; P = 7.5 × 10-13); this association was attenuated but remained statistically significant after excluding SNPs individually associated with MPM (OR = 1.75, 95% CI, 1.32-2.31). CONCLUSIONS: Inherited genetic variants spanning 11 gene regions were independently associated with MPM. Nonsignificant SNPs were associated with MPM when aggregated into a PRS, indicating that their cumulative effect may influence MPM risk despite lacking individual statistical significance in our study population. IMPACT: Our findings provide additional evidence that these loci are associated with melanoma risk and estimate the magnitude of their genetic effect on subsequent (multiple) primary melanoma risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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