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Enregistrement W4408244740 · doi:10.1021/jacs.4c12543

Structure and pH Dependence of Membranolytic Mechanisms by Truncated Oxidized Phospholipids

2025· article· en· W4408244740 sur OpenAlexafffund
Min Xie, Maik G. N. Derks, Eveline H. W. Koch, C. Bjorn van Boven, Minchakarn Janlad, Behnaz Bagheri, Zexi Xu, Daria Kovryzhenko, Cornelis A. van Walree, Ana Sobota, Markus Weingarth, Jirasak Wong-ekkabut, Mikko Karttunen, Eefjan Breukink, J. Antoinette Killian, Andreas F.‐P. Sonnen, Joseph H. Lorent

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlliance de recherche numérique du CanadaChina Scholarship CouncilThailand Science Research and InnovationUniversiteit UtrechtTechnische Universiteit EindhovenFédération Wallonie-BruxellesCanada Research Chairs
Mots-clésChemistryMembraneLipid bilayerBiophysicsBilayerMoleculeCell membraneCarboxylic acidBiochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Membrane lipid oxidation is a universal process that occurs in situations of oxidative stress and is encountered in numerous physiological and pathological situations. Oxidized truncated phospholipids make up a large part of the oxidation products and alter the membrane properties in a way that can lead to cell death. However, the underlying mechanisms are not well understood nor is it clear whether environmental factors, such as pH, can modulate these effects. Using model membranes, we investigate how individual lipid aldehydes and carboxylic acids with truncated acyl chains alter the membrane structure. Our data shows that lipid aldehydes and carboxylic acids have different permeabilization efficiencies towards molecules of varying charge and size and that ΔC9 truncated lipids are usually more efficient in permeabilizing membranes than ΔC5. In terms of physical mechanisms, the ΔC9 truncated lipid carboxylic acid induces permeabilization and membrane curvature in a pH-dependent fashion. This is explained by ionization-dependent exposure of the carboxyl group to the water-bilayer interface, which increases the intrinsic molecular curvature of the oxidized lipid. Conversely, ΔC9 truncated lipid aldehydes and nonionized carboxyls do not induce curved structures but are more efficient in increasing permeability toward larger molecules. We further show that truncated lipids can escape the bilayer and accumulate at interfaces, implying that they might act on neighboring cells. This study indicates that oxidized phospholipids with truncated acyl chains disrupt membrane structure, depending on their specific molecular structure and the pH of the environment, opening a possible route for the design of lipid nanoparticles with pH-dependent drug release.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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