Characterization of RNA Helicase Genes in Ustilago maydis Reveals Links to Stress Response and Teliospore Dormancy
Notice bibliographique
Résumé
Fungi produce dormant structures that are responsible for protection during adverse environmental conditions and dispersal (disease spread). Ustilago maydis, a basidiomycete plant pathogen, is a model for understanding the molecular mechanisms of teliospore dormancy and germination. Dormant teliospores store components required for germination including mRNAs which may be stored as dsRNAs. RNA helicases are conserved enzymes that function to modulate, bind, and unwind RNA duplexes, and can displace other proteins. We hypothesize that RNA helicases function during teliospore dormancy to stabilize and/or modulate stored mRNAs. We identified the U. maydis udbp3 and uded1 as encoding RNA helicases of interest as they are upregulated in the dormant teliospore and decrease during germination. Experimental results suggest that udbp3 may function as a negative regulator of osmotic stress-responsive genes and that uded1 modulates stress response by repressing translation. The altered expression of uded1 also results in slow growth, polarized growth, and the formation of dsRNA. Together, the data support a role for both helicases modulating gene expression, in response to stress, leading to teliospore dormancy and also modulating responses for teliospore germination. Increasing our molecular understanding of these processes will aid in developing novel strategies to mitigate disease spread.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».