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Enregistrement W4408289760 · doi:10.1094/mpmi-12-24-0159-fi

Transcriptional Profiling and Genetic Mapping of Barley Responses to Bacterial Flagellin

2025· article· en· W4408289760 sur OpenAlexafffundabout
Elizabeth K. Brauer, Whynn Bosnich, Monique Power, Doris Luckert, S. K. Khanal, Nathan Liang, Moatter Syed, Martin Charette, Danielle Wolfe, Arezo Pattang, Hannah Morrison, Stephanie Poncos, James R. Tucker, Raja Khanal, Jean‐Sébastien Parent, Bahram Samanfar

Notice bibliographique

RevueMolecular Plant-Microbe Interactions · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensCarleton UniversityUniversity of TorontoUniversity of OttawaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésFlagellinBiologyArabidopsisGeneGeneticsMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diverse plant species detect bacterial flagellin using leucine-rich repeat receptor-like kinases to activate defense responses and promote resistance against bacterial invasion. In barley, the impact of flagellin on inducible defense responses has not been fully described. Here, we report that the flagellin-derived flg22 peptide induces callose, reactive oxygen species (ROS) bursts, and differential expression of 2,603 genes in barley. Cultivated barley genotypes produce different amplitudes of flg22-induced ROS bursts, indicating genetic variation for microbe-associated molecular pattern responses. Association mapping revealed a region on chromosome 7 underlying variation in flg22-induced ROS bursts, which contains 12 flg22-induced genes. Genotypes with higher flg22 responses had higher induced resistance to Xanthomonas translucens pv. translucens ( Xtt), the causal organism of bacterial leaf streak. The flg22 region of Xtt flagellin evades detection in both barley and Arabidopsis, and a single amino acid change can restore immunogenicity of the peptide. Together, this work underlines the effectiveness of the flagellin-triggered defenses in promoting barley resistance to Xtt, which evades recognition of the flg22 region in its host. [Formula: see text]Copyright © 2025 His Majesty the King in Right of Canada, as represented by the Minister of Agriculture and Agri-Food Canada. This is an open access article distributed under the CC BY-NC-ND 4.0 International license .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,201
Score d'incertitude au seuil0,296

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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