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Enregistrement W4408343933 · doi:10.1128/jvi.00048-25

The GP2a 91/97/98 amino acid substitutions play critical roles in determining PRRSV tropism and infectivity but do not affect immune responses

2025· article· en· W4408343933 sur OpenAlexaff
Ming Qiu, Shuai Li, Shubin Li, Zhe Sun, Lin Hong, Shuai Yang, Meng Cui, Yuejia Qiu, Wenhao Qi, Xiuling Yu, Shaobin Shang, Kegong Tian, François Meurens, Jianzhong Zhu, Nanhua Chen

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAnimal Virus Infections Studies
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesHigher Education Discipline Innovation ProjectPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésBiologyTropismPorcine reproductive and respiratory syndrome virusVirologyInfectivityTissue tropismArterivirusImmune systemVirusGeneticsCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Infectious disease (medical specialty)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

and are commonly used for PRRS vaccine development. However, currently prevalent PRRSV isolates display different Marc-145 cell tropism while the exact determinant is not clarified yet. In this study, we identified for the first time that the 91/97/98 amino acid (aa) substitutions in GP2a of PRRSV play critical roles in determining Marc-145 adaptation. Specifically, multiple series of chimeric viruses were constructed based on four PRRSV infectious clones including Marc-145 adaptive HP-PRRSV-2 strain and Marc-145 non-adaptive NADC34-like PRRSV-2, NADC30-like PRRSV-2, and PRRSV-1 strains. The GP2a 91/97/98 aa substitutions are a sufficient and necessary determinant in NADC34-like and NADC30-like PRRSV-2, a sufficient but not necessary determinant in HP-PRRSV-2, a necessary but not sufficient determinant in PRRSV-1, respectively. In addition, the GP2a substitutions also influenced PRRSV infectivity in PAMs and piglets. Noticeably, the GP2a substitutions did not significantly affect the levels of neutralizing antibodies, porcine T follicular helper (Tfh) cells, and PRRSV-specific IFNγ secreting cells. Overall, our results not only provide new insights into PRRSV tropism and infectivity but also will facilitate PRRS vaccine development. IMPORTANCE: . Clarifying the exact determinant of PRRSV tropism is crucial for PRRSV isolation and vaccine development. By constructing chimeric viruses based on four representative PRRSV infectious clones, we identified for the first time that the 91/97/98 amino acid substitutions in GP2a play critical but distinct roles in determining Marc-145 cell tropism for different PRRSV strains. The GP2a 91/97/98 amino acid substitutions also affect PRRSV infectivity in PAMs and piglets but do not influence immune responses. This study not only deciphers an exact determinant of PRRSV tropism and infectivity but also has guiding significance for PRRS vaccine development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,751
Score d'incertitude au seuil0,499

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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