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Enregistrement W4408344009 · doi:10.1093/neuonc/noaf061

Germline analysis of an international cohort of pediatric diffuse midline glioma patients

2025· article· en· W4408344009 sur OpenAlexaff
Marion K. Mateos, Pamela Ajuyah, Noemi Fuentes-Bolanos, Sam El-Kamand, Paulette Barahona, Ann-Kristin Alteköester, Chelsea Mayoh, Holly Holliday, Jie Liu, Lujing Cui, Elke Pfaff, Alan Mackay, Mark Pinese, Loretta M. S. Lau, Dong-Anh Khuong-Quang, Kimberly Dias, Catherine Goudie, Alison Salkeld, Jo Lynne Rokita, David Jones, Nikoleta Juretic, Elisha Hayden, Stefan M. Pfister, Christof M. Kramm, Mirjam Blattner-Johnson, Nada Jabado, Maria Tsoli, Orazio Vittorio, Sabine Mueller, Yiran Guo, Kathy Tucker, Sebastian M. Waszak, Sébastien Perreault, Chris Jones, Marie Wong, Mark J. Cowley, David S. Ziegler

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineMcGill UniversityMcGill Genome CentreUniversité de MontréalMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesMedical Research Future FundAustralian Lions Childhood Cancer Research Foundation
Mots-clésGermlinePALB2Germline mutationCarcinogenesisGeneticsCancer researchMedicineGliomaExome sequencingBiologyCancerOncologyGeneMutation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Factors that drive the development of diffuse midline gliomas (DMG) are unknown. Our study aimed to determine the prevalence of pathogenic/likely pathogenic (P/LP) germline variants in pediatric patients with DMG. METHODS: We assembled an international cohort of 252 pediatric patients with DMG, including diffuse intrinsic pontine glioma (n = 153), with germline whole genome or whole exome sequencing. RESULTS: We identified P/LP germline variants in cancer predisposition genes in 7.5% (19/252) of patients. Tumor profiles differed, with the absence of somatic drivers in the PI3K/mTOR pathway in patients with germline P/LP variants versus those without (P = .023). P/LP germline variants were recurrent in homologous recombination (n = 9; BRCA1, BRCA2, PALB2) and Fanconi anemia genes (n = 4). Somatic findings established that the germline variants definitively contributed to tumorigenesis in at least 1% of cases. One patient with recurrent DMG and pathogenic germline variants (BRCA2, FANCE) showed a near-complete radiological response to PARP and immune checkpoint inhibition. CONCLUSIONS: Our study determined the prevalence of pathogenic germline variants in pediatric DMG and suggests a role in tumorigenesis for a subset of patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,372

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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