Notice bibliographique
Résumé
Flax (Linum usitatissimum L.) is one of the founder crops domesticated for oil and fiber uses in the Near-Eastern Fertile Crescent, but its domestication history remains largely elusive. Genetic inferences so far have expanded our knowledge in several aspects of flax domestication such as the wild progenitor, the first use of domesticated flax, and domestication events. However, little is known about flax domestication processes involving multiple domestication events. This study applied genotyping-by-sequencing to infer flax domestication processes. Ninety-three Linum samples representing four flax domestication groups (oilseed, fiber, winter and capsular dehiscence) and its wild progenitor (or pale flax; L. bienne Mill.) were sequenced. SNP calling identified 16,998 SNPs that were widely distributed across 15 flax chromosomes. Diversity analysis found that pale flax had the largest nucleotide diversity, followed by indehiscent, winter, oilseed and fiber cultivated flax. Pale flax seemed to be under population contraction, while the other four domestication groups were under population expansion after bottleneck. Demographic inferences showed that five Linum groups carried clear genetic signals of multiple mixture events that were associated largely with oilseed flax. Phylogenetic analysis revealed that oilseed, fiber and winter flax formed two separate phylogenetic subclades. One subclade had abundant winter flax, along with some oilseed and fiber flax, mainly originating in the Near East and nearby regions. The other subclade mainly had oilseed and fiber flax originating from Europe and other parts of the world. Dating genetic divergences with an assumption of 10,000 years before present (BP) of flax domestication revealed that oilseed and fiber flax spread to Europe 5800 years BP and domestication for winter hardiness occurred in the Near East 5100 years BP. These findings provide new significant insights into flax domestication processes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».