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Enregistrement W4408573322 · doi:10.3390/bioengineering12030308

Benchmarking Interpretability in Healthcare Using Pattern Discovery and Disentanglement

2025· article· en· W4408573322 sur OpenAlexaff
Pei-Yuan Zhou, Amane Takeuchi, Fernando Martinez Lopez, Malikeh Ehghaghi, Andrew K. C. Wong, En-Shiun Annie Lee

Notice bibliographique

RevueBioengineering · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensOntario Tech UniversityUniversity of TorontoUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésInterpretabilityBenchmarkingComputer scienceCluster analysisArtificial intelligenceMachine learningBenchmark (surveying)Feature (linguistics)Data miningKnowledge extractionClinical decision support systemDecision support system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The healthcare industry seeks to integrate AI into clinical applications, yet understanding AI decision making remains a challenge for healthcare practitioners as these systems often function as black boxes. Our work benchmarks the Pattern Discovery and Disentanglement (PDD) system's unsupervised learning algorithm, which provides interpretable outputs and clustering results from clinical notes to aid decision making. Using the MIMIC-IV dataset, we process free-text clinical notes and ICD-9 codes with Term Frequency-Inverse Document Frequency and Topic Modeling. The PDD algorithm discretizes numerical features into event-based features, discovers association patterns from a disentangled statistical feature value association space, and clusters clinical records. The output is an interpretable knowledge base linking knowledge, patterns, and data to support decision making. Despite being unsupervised, PDD demonstrated performance comparable to supervised deep learning models, validating its clustering ability and knowledge representation. We benchmark interpretability techniques-Feature Permutation, Gradient SHAP, and Integrated Gradients-on the best-performing models (in terms of F1, ROC AUC, balanced accuracy, etc.), evaluating these based on sufficiency, comprehensiveness, and sensitivity metrics. Our findings highlight the limitations of feature importance ranking and post hoc analysis for clinical diagnosis. Meanwhile, PDD's global interpretability effectively compensates for these issues, helping healthcare practitioners understand the decision-making process and providing suggestive clusters of diseases to assist their diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,039
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,046

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,039
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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