MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4408777622 · doi:10.1101/2025.03.21.644618

The Short Isoform of the Mouse Actin Adaptor Protein Synaptopodin-2 Activates Actin-Responsive Transcription Factors and Enhances Myoblast Fusion

2025· preprint· en· W4408777622 sur OpenAlexaff
Nandini N. Margam, FuiBoon Kai, Victor Chichkov, Colin Crist, Roy Duncan

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill Genome CentreDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSignal transducing adaptor proteinCell biologyGene isoformFusion proteinSynaptopodinActinChemistryTranscription factorActin-binding proteinBiologyActin cytoskeletonRecombinant DNABiochemistryCytoskeletonSignal transductionCellGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Expression of synaptopodin-2 (SYNPO2), an actin cytoskeleton adaptor protein, is up-regulated following myoblast differentiation into myocytes and subsequently myotubes but no functional role in muscle development has been attributed to SYNPO2. We now show that of the three known mouse SYNPO2 isoforms, only the shortest isoform, SYNPO2As, is upregulated following differentiation of C2C12 myoblasts and primary mouse muscle satellite cells. Consistent with the differentiation-dependent expression pattern of these different isoforms, ectopic expression of SYNPO2As significantly increased myotube formation while the two large SYNPO2 isoforms (SYNPO2A or SYNPO2B) inhibited myocyte fusion into multinucleated myotubes. Irrespective of the fusion phenotype, all three isoforms enhanced migration of differentiating myoblasts. Knockdown studies using shRNA confirmed a pro-myogenic role for the short SYNPO2As isoform. Interestingly, SYNPO2As-transduced cells increased the transcript levels of late myogenic differentiation markers in the STARS (striated muscle activator of Rho signaling) and SRF (serum response factor) pathways that correlated with the enhanced fusion phenotype. These results identify the actin adaptor protein SYNPO2As as a new pro-myogenic factor that upregulates late myogenic differentiation markers and myotube formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetRNA Research and Splicing→Travaux en français237 207→