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Enregistrement W4408845928 · doi:10.1093/jac/dkaf085

Comparing serotype coverage of pneumococcal vaccines with PCV21 (V116), a new 21-valent conjugate pneumococcal vaccine, and the epidemiology of its eight unique <i>Streptococcus pneumoniae</i> serotypes (15A, 15C, 16F, 23A, 23B, 24F, 31 and 35B) causing invasive pneumococcal disease in adult patients in Canada: SAVE study, 2018–21

2025· article· en· W4408845928 sur OpenAlexafffundabout
John J. Schellenberg, Heather J. Adam, Melanie Baxter, James A. Karlowsky, Alyssa Golden, Irene Martín, George G. Zhanel

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesMerck CanadaPublic Health AgencyPublic Health Agency of CanadaUniversity of Manitoba
Mots-clésSerotypeStreptococcus pneumoniaePneumococcal conjugate vaccineVirologyPneumococcal infectionsConjugate vaccineMedicineStreptococcaceaeConjugateMicrobiologyPneumococcal vaccineImmunologyBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: V116 is a novel 21-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV) intended for use in adults. OBJECTIVES: To estimate current V116 serotype coverage in adult patients in Canada compared with PCV15, PCV20 and PPSV23 vaccines, and to describe isolate demographics for the eight unique serotypes (15A, 15C, 16F, 23A, 23B, 24F, 31 and 35B) covered by V116. METHODS: From 2018 to 2021 inclusive, the SAVE study collected 5854 invasive pneumococcal disease (IPD) isolates as part of a collaboration between the Canadian Antimicrobial Resistance Alliance and the Public Health Agency of Canada-National Microbiology Laboratory. Serotypes were determined by Quellung reaction and antimicrobial susceptibility testing performed using the CLSI broth microdilution method. RESULTS: For adult patients (≥18 years), adults 50-64 years and adults ≥65 years, respectively, IPD isolate coverage was PCV15 (42.7%; 41.0%, 39.8%), PCV20 (59.0%; 60.2%, 52.2%), PPSV23 (70.4%; 75.1%, 60.0%), V116 (78.9%; 76.3%, 81.5%) and V116 plus PCV20 (92.2%; 91.0%, 89.3%). The eight unique V116 serotypes accounted for 19.7% and 26.8% of IPD isolates from adults and adults ≥65 years, respectively. Among the eight unique V116 serotypes, 15A and 23A demonstrated the highest rates of MDR (17.0% and 10.2%, respectively); 6.7% of 15A isolates were XDR. CONCLUSIONS: V116 provided significantly (P < 0.05) greater coverage than PCV15, PCV20 and PPSV23 for adults, including older adults, across all Canadian geographic regions, and against IPD isolates with common antimicrobial resistance phenotypes, including MDR. The eight unique V116 serotypes accounted for a higher proportion of IPD isolate serotypes in patients aged ≥65 years than younger adults.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,161

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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