Comparing serotype coverage of pneumococcal vaccines with PCV21 (V116), a new 21-valent conjugate pneumococcal vaccine, and the epidemiology of its eight unique <i>Streptococcus pneumoniae</i> serotypes (15A, 15C, 16F, 23A, 23B, 24F, 31 and 35B) causing invasive pneumococcal disease in adult patients in Canada: SAVE study, 2018–21
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: V116 is a novel 21-valent pneumococcal conjugate vaccine (PCV) intended for use in adults. OBJECTIVES: To estimate current V116 serotype coverage in adult patients in Canada compared with PCV15, PCV20 and PPSV23 vaccines, and to describe isolate demographics for the eight unique serotypes (15A, 15C, 16F, 23A, 23B, 24F, 31 and 35B) covered by V116. METHODS: From 2018 to 2021 inclusive, the SAVE study collected 5854 invasive pneumococcal disease (IPD) isolates as part of a collaboration between the Canadian Antimicrobial Resistance Alliance and the Public Health Agency of Canada-National Microbiology Laboratory. Serotypes were determined by Quellung reaction and antimicrobial susceptibility testing performed using the CLSI broth microdilution method. RESULTS: For adult patients (≥18 years), adults 50-64 years and adults ≥65 years, respectively, IPD isolate coverage was PCV15 (42.7%; 41.0%, 39.8%), PCV20 (59.0%; 60.2%, 52.2%), PPSV23 (70.4%; 75.1%, 60.0%), V116 (78.9%; 76.3%, 81.5%) and V116 plus PCV20 (92.2%; 91.0%, 89.3%). The eight unique V116 serotypes accounted for 19.7% and 26.8% of IPD isolates from adults and adults ≥65 years, respectively. Among the eight unique V116 serotypes, 15A and 23A demonstrated the highest rates of MDR (17.0% and 10.2%, respectively); 6.7% of 15A isolates were XDR. CONCLUSIONS: V116 provided significantly (P < 0.05) greater coverage than PCV15, PCV20 and PPSV23 for adults, including older adults, across all Canadian geographic regions, and against IPD isolates with common antimicrobial resistance phenotypes, including MDR. The eight unique V116 serotypes accounted for a higher proportion of IPD isolate serotypes in patients aged ≥65 years than younger adults.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».