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Enregistrement W4408899521 · doi:10.1016/j.molcel.2025.03.004

Widespread variation in molecular interactions and regulatory properties among transcription factor isoforms

2025· article· en· W4408899521 sur OpenAlexaff
L. Lambourne, Kaia Mattioli, Clarissa Santoso, Gloria Sheynkman, Sachi Inukai, Babita Kaundal, Anna Berenson, Kerstin Spirohn-Fitzgerald, Anukana Bhattacharjee, Elisabeth Rothman, Shaleen Shrestha, Florent Laval, Stephen P. Plassmeyer, Ryan J. Emenecker, Zhipeng Yang, Deepa Bisht, Jared Allan Sewell, Guangyuan Li, Anisa Prasad, Sabrina K. Phanor, Ryan Lane, Devlin C. Moyer, Toby Hunt, Dawit Balcha, Marinella Gebbia, Jean‐Claude Twizere, Tong Hao, Alex S. Holehouse, Adam Frankish, Josh A. Riback, Nathan Salomonis, Michael A. Calderwood, David E. Hill, Nidhi Sahni, Marc Vidal, Martha L. Bulyk, Juan I. Fuxman Bass

Notice bibliographique

RevueMolecular Cell · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Chromatin Dynamics
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesBelgian American Educational FoundationMelanoma Research FoundationNational Human Genome Research InstituteWallonie-Bruxelles InternationalCharles A. King TrustFonds De La Recherche Scientifique - FNRSMelanoma Research AllianceNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthAndrew Sabin Family FoundationFonds Léon Fredericq
Mots-clésBiologyTranscription factorGene isoformVariation (astronomy)Computational biologyGeneticsCell biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,032
Score d'incertitude au seuil0,639

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,187 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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