Model-Based Characterization of the Metabolism of Recombinant Adeno-Associated Virus (rAAV) Production via Human Embryonic Kidney (HEK293) Cells
Notice bibliographique
Résumé
In this paper, we present a kinetic-metabolic model describing adeno-associated virus (AAV) production via HEK293 cells that encompasses the main metabolic pathways, namely, glycolysis, tricarboxylic acid cycle (TCA), pyruvate fates, the pentose phosphate pathway, anaplerotic reaction, amino acid metabolism, nucleotides synthesis, biomass synthesis, and the metabolic pathways of protein synthesis of the AAV (capsid and Rep proteins). For the modeling, Michaelis-Menten kinetics was assumed to define the metabolic model. A dataset from bioreactor cultures containing metabolite profiles of adeno-associated virus 6 (AAV6) production via triple transient transfection in a low-cell-density culture, including the concentration profiles of glutamine, glutamic acid, glucose, lactate, and ammonium, was utilized for fitting and computing the model parameters. The model that resulted from the adjusted parameters defined the experimental data well. Subsequently, a Sobol-based global sensitivity analysis procedure was applied to determine the most sensitive parameters in the final model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».