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Enregistrement W4408975093 · doi:10.1016/j.ympev.2025.108341

Novel island species elucidate a species complex of Neotropical crocodiles

2025· article· en· W4408975093 sur OpenAlexafffund
Jose Avila Cervantes, Pierre Charruau, Hoai-Nam Bui, Miryam Venegas‐Anaya, Marta Vargas, Marco A. López‐Luna, Héctor González-Cortés, David A Macías-Díazg, Jonathan S Pérez-Flores, Gabriel Barrios-Quiroz, Jané Salazar, W. Owen McMillan, Hans C. E. Larsson

Notice bibliographique

RevueMolecular Phylogenetics and Evolution · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueEvolution and Paleontology Studies
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesSmithsonian Tropical Research InstituteNational Research Council CanadaCanada Foundation for InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaConsejo Nacional de Ciencia y TecnologíaMcGill University
Mots-clésBiologyEcologySpecies complexEvolutionary biologyZoologyPhylogenetic treeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

• New collaborative research on the discovery of cryptic genetic diversity and rapid evolution of Neotropical crocodiles. • This is the first attempt to use full genomic RAD sequencing technology on crocodiles. • This works presents the first combined genomic and phenomic assessment of Neotropical crocodile evolution. • The work proposes two novel insular species of crocodiles highlighting their genetic, phenotypic, and geographic diversity. The evolutionary history of Neotropical crocodiles has remained elusive. They inhabit a broad geographic range with populations spanning from coastal, inland, and insular locations. Using a selection of natural insular, coastal, and one inland population of C. acutus , coastal C. moreletii , and the single surviving population of C. rhombifer , we discovered a remarkable genetic diversity for the group. Moreover, geometric morphometric results of skull shapes shows that these crocodylus species span a morphological cline. We recovered a high genetic differentiation between C. moreletii , C. rhombifer , and five clusters of C. acutus . The genetic and geographic differences among the C. acutus clusters were used to suggest these may be a species complex. Several ecological, morphological and genetics traits are identified in the well-studied populations from Banco Chinchorro and Cozumel islands off the Mexican Yucatan Peninsula to support discrete species designations for these populations. This work suggests the presence of rapid, recent evolution of several cryptic Crocodylus species throughout the Neotropics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,020

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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