Blood and colostral IgM and IgG B cell repertoires in high, average, and low immune responder Holstein Friesian cows and heifers
Notice bibliographique
Résumé
In dairy cattle, genetic selection for higher antibody-mediated (AMIR) and cell-mediated (CMIR) immune responses can enhance disease resistance. Cattle produce a unique subset of B cells with B cell receptors with ultralong complementarity determining regions 3 (CDR3). Antibodies with these specialized structures have superior virus neutralization characteristics. Published studies of B cell receptors with ultralong CDR3s in dairy cattle have been limited by the number of animals examined (1–4 animals in each study), and by varying breeds and ages. The objective of this study was to assess the percentage of IgM and IgG sequences with ultralong CDR3s, and gene usage in blood and colostral lymphocytes from cows classified as high, average, and low immune responders based on their estimated breeding values. B lymphocytes were isolated from the blood of 14 heifers and 7 cows. In addition, cells were isolated from colostrum of the 7 cows. RNA was extracted, cDNA was produced, and IgM and IgG transcripts were amplified using polymerase chain reactions. Amplicons were sequenced using Oxford Nanopore long-read sequencing. In sequences derived from blood B cells, AMIR estimated breeding values were significantly and positively associated with higher percentages of IgG ultralong CDR3 sequences. High AMIR cows (n = 3) also produced colostrum with a significantly greater percentage of IgG ultralong CDR3 sequences (18.0 %) than average AMIR cows (n = 4, mean 8.8 %). Larger studies are needed to investigate the association between percentages of B cells expressing IgG ultralong CDR3s and observed health traits. • Cattle produce B cells with ultralong CDR3s with extraordinary virus neutralization. • There are limited studies of B cell receptor repertoires of Holstein cattle. • High AMIR cows had higher percent ultralong CDR3s in blood and colostrum. • Selecting for high AMIR and high percents of ultralong CDR3s could improve health.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».