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Enregistrement W4409003617 · doi:10.1016/j.plaphy.2025.109841

Promiscuous and regiospecific Vinca minor hydroxylases for opioid akuammine biosynthesis and monoterpenoid indole alkaloid diversification

2025· article· en· W4409003617 sur OpenAlexafffund
Zhan Mai, Matthew Bailey Richardson, S. G. MANN, Jacob Owen Perley, Ghislain Deslongchamps, Yang Qu

Notice bibliographique

RevuePlant Physiology and Biochemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiqueAlkaloids: synthesis and pharmacology
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlliance de recherche numérique du CanadaNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésIndole alkaloidBiosynthesisAlkaloidChemistryStereochemistryBiologyBotanyBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The medicinal plant Vinca minor produces vincamine, a compound used for neurodegenerative diseases, along with a diverse array of monoterpenoid indole alkaloids (MIAs) primarily within the aspidosperma and akuammiline subclasses. While recent studies have elucidated the core biosynthetic pathways for these subclasses, the transformations of key intermediates into the vast diversity of naturally occurring alkaloids remain poorly understood. In this study, we identify and characterize two promiscuous cytochrome P450 monooxygenases (CYPs) in V. minor : vincaminoreine/pericyclivine 10-hydroxylase (VmV10H) and pseudoakuammigine 10-hydroxylase (VmPs10H), both exhibiting high substrate versatility. VmV10H catalyzes the hydroxylation of structurally diverse MIAs, including vincaminoreine, pericyclivine, apparicine, and akuammidine, while VmPs10H demonstrates a preference for akuammiline type MIAs such as pseudoakuammigine, picrinine, and strictamine. Homology modeling and substrate docking reveal active site architecture of these enzymes, suggesting a consistent mechanism for C10 hydroxylation across all substrates. The discovery of VmV10H and VmPs10H not only broadens our understanding of MIA biosynthesis but also expands the enzymatic toolkit for the metabolic engineering of pharmaceutical MIAs, including akuammine, a μ-opioid receptor agonist with analgesic properties. • Metabolic profiling reveals tissue-specific alkaloid accumulation in Vinca minor. • A new V. minor enzyme catalyzes vincaminoreine and pericyclivine 10-hydroxylation. • A second enzyme hydroxylates pseudoakuammigine/picrinine/strictamine at C10. • Homology modeling shows key features for reaction promiscuity and regiospecificity. • Pseudoakuammigine 10-hydroxylase enables the biosynthesis of the opioid akuammine.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,037
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,339
Écart entre enseignants0,297 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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