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Enregistrement W4409189524 · doi:10.1002/em.70006

Benchmark Response (<scp>BMR</scp>) Values for In Vivo Mutagenicity Endpoints

2025· article· en· W4409189524 sur OpenAlexafffund
Paul A. White, Guangchao Chen, Nikolai L. Chepelev, Madison A. Bell, Lauren R. Gallant, George E. Johnson, Andreas Zeller, Marc A. Beal, Alexandra S. Long

Notice bibliographique

RevueEnvironmental and Molecular Mutagenesis · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensUniversity of OttawaHealth Canada
Organismes subventionnairesRijksinstituut voor Volksgezondheid en MilieuHealth Canada
Mots-clésIn vivoClinical endpointStatisticsBenchmark (surveying)ToxicologyBiologyMathematicsBiotechnologyBioinformaticsClinical trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The benchmark dose (BMD) approach constitutes the most effective and pragmatic strategy for the derivation of a point of departure (PoD) for comparative potency analysis, risk assessment, and regulatory decision-making. There is considerable controversy regarding the most appropriate benchmark response (BMR) for genotoxicity endpoints. This work employed the Slob (2017) Effect Size (ES) theory to define robust BMR values for the in vivo transgenic rodent (TGR) and Pig-a mutagenicity endpoints. An extensive database of dose-response data was prepared and curated; BMD analyses were used to determine endpoint-specific maxima (i.e., parameter c) and within-group variance (i.e., var). Detailed analyses investigated the dependence of var on experimental factors such as tissue, administration route, treatment duration, and post-exposure tissue sampling time. The overall lack of influence of these experimental factors on var permitted the determination of typical values for the endpoints investigated. Typical var for the TGR endpoint is 0.19; the value for the Pig-a endpoint is 0.29. Endpoint-specific var values were used to calculate endpoint-specific BMR values; the values are 47% for TGR and 60% for Pig-a. Endpoint-specific BMR values were also calculated using the trimmed distribution of study-specific standard deviation (SD) values for concurrent controls. Those analyses yielded endpoint-specific BMR values for the TGR and Pig-a endpoints of 33% and 58%, respectively. Considering the results obtained, and the in vivo genetic toxicity BMR values noted in the literature, we recommend a BMR of 50% for in vivo mutagenicity endpoints. The value can be employed to interpret mutagenicity dose-response data in a risk assessment context.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,067
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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