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Enregistrement W4409197215 · doi:10.1139/cjm-2024-0137

Survey of fungal endophytes in barley under Fusarium head blight infection

2025· article· en· W4409197215 sur OpenAlexafffundvenue
Denice Embrador, Zoe Quill, James R. Tucker, Ana Badea, Champa Wijekoon

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensBrandon UniversityCanadian Science Centre for Human and Animal HealthResearch ManitobaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésBiologyFusariumEndophyteHordeum vulgareBotanyPoaceaeFungi imperfectiMycotoxinAgronomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fusarium head blight (FHB) is a devastating fungal disease caused by Fusarium graminearum, which affects barley ( Hordeum vulgare L.) and other small cereal grains. Fungal endophytes are microorganisms that reside inside tissues and considered that they may have been involved in various roles of the plants. This study involved the comparison of fungal endophytes between “non-infected/clean” and “FHB-infected” barley genotypes in various tissues collected at different plant developmental stages and were grown under different conditions (i.e., greenhouse, research field, and FHB-field nursery). We hypothesized that fungal endophytes diversity and abundance may differ between plant tissues in various barley genotypes that were non-infected and FHB-infected. The 18S-internal transcribed spacer sequencing analysis revealed a greater number of fungal operational taxonomic units (OTUs) and endophyte species in FHB-infected barley compared to clean barley. A one-way ANOVA and Tukey's pairwise comparison test ( p ≤ 0.05) were performed to test significant differences. Higher seed endophyte diversity was found in FHB-infected (120 OTUs) compared to non-infected (113 OTUs) harvested in 2021. The increase in diversity of endophytes that contributes to different roles in plant protection and defense, such as biocontrol agents, may prevent the growth of Fusarium species and decrease FHB-infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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