Molecular recognition and phylogenetic tree analysis of Cystoisospora canis in stray dogs in Diwaniyah city, Iraq
Notice bibliographique
Résumé
Cystoisospora spp. are Apicomplexa parasites, protozoan parasites with a global prevalence of 1-5% in dogs. The current study aimed at finding out about the presence and molecular features of Cystoisospora among homeless dogs in Al-Diwaniyah province in Iraq. The 200 fecal samples from street dogs from various regions were floated, sedimented and then tested by direct smear. We identified molecularly using PCR from the 18S rRNA gene and sequenced and phylogenetic. A 19% prevalence of Cystoisospora spp. was observed under microscope, the province’s first known case of the parasite. In our infection dogs, the infection rates were higher in females 22.34% than males 16.03%. Younger dogs (puppies) were much more common with prevalence at 38.02%, compared with 8.52% for the older dogs. Cystoisospora DNA was found in 56% (17/30) of the specimens by PCR. Sequence alignment of the 511 bp region of the 18S rRNA gene identified 100% identity with Cystoisospora canis strains already in GenBank from Canada. The strains in locality were identified as Cystoisospora canis by phylogenetic recognition including Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA). The molecular phylogenetic data from this research on Cystoisospora canis in Iraqi street dogs represents the first such molecular phylogenetic data on this parasite in Iraq and adds to the epidemiology of this parasite in Iraq.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».