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Enregistrement W4409342528 · doi:10.1038/s41420-026-03116-9

Enhanced Precision in Cell Culture Analytics: Leveraging Artificial Intelligence for Unbiased and Non-Destructive Assessment of Cell Growth and Viability.

2025· preprint· en· W4409342528 sur OpenAlexfundno aff
Cheung Pang Wong, Nasrin Khazamipour, Soroush Aalibagi, Louise Ramos, Joya Maria Saade, Casper Dolleris, Janny Marie L. Peterslund, Daria Golanarian, Negin Farivar, Mads Daugaard

Notice bibliographique

RevueCell Death Discovery · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell Image Analysis Techniques
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreCanadian Institutes of Health ResearchMitacs
Mots-clésAnalyticsComputer scienceData scienceArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Precise assessment of cell growth, count, and viability is a prerequisite for biological and medical research. Traditional cell analytics involve manual processes, such as cell counting or reagent-based approaches that are user-dependent and prone to bias. Semi-automated systems for counting cells, tracking cell growth, and determining viability have been introduced over the past decades. However, these methods are often time-consuming, require labeling steps, and involve costly instrumentation and consumables. Changes in cell growth and/or viability create biological patterns that can be interpreted by artificial intelligence (AI). Here, we report the development and validation of SnapCyte™, an AI application that performs accurate, unbiased, label- and reagent-free cell analyses from basic cell culture images. Using cell lines with diverse morphologies in various culture conditions, we generated a comprehensive and fully annotated image database that was used for AI education. Convolutional neural networks were employed for cell localization and iterative training loops until a stable performance of >95% accuracy was obtained for all readouts. The fully trained AI demonstrated high Precision and Recall and performed with greater accuracy and less variation as compared to standard methods. As the SnapCyte analyses are performed on cell images only, data acquisition is non-invasive to the experimental setup, enabling real-time use of cells in downstream assays. In summary, SnapCyte is a fast and accurate cell analytics platform, resistant to user variations and independent of reagents or specific equipment, with improved performance over current cell analytics methodologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,311
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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