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Enregistrement W4409353814 · doi:10.1016/j.xops.2025.100793

Systematic Review of Proteomics in Age-Related Macular Degeneration and Pathway Analysis of Significant Protein Changes

2025· review· en· W4409353814 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueOphthalmology Science · 2025
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRetinal Diseases and Treatments
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNova Scotia Health AuthorityNational Eye InstituteAristotle University of ThessalonikiONL TherapeuticsLowy Medical Research InstituteHope FoundationMacula SocietySunovionMassachusetts Eye and EarValeant Pharmaceuticals InternationalHeed Ophthalmic Foundation
Mots-clésMacular degenerationProteomicsPathway analysisMedicineComputational biologyBioinformaticsBiologyOphthalmologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Topic: Proteomics in age-related macular degeneration (AMD) research. Clinical Relevance: AMD is the leading cause of blindness in industrialized countries, with a poorly understood pathogenesis. Proteomics can identify significantly altered proteins in AMD patients, aiding in understanding the disease's pathophysiology and potentially improving diagnosis or treatment strategies. Methods: A systematic review of proteomic studies in AMD was conducted. Proteins significantly altered in dry and wet AMD and those tested as biomarkers were presented according to sample type (aqueous humor, plasma, urine, vitreous, retinal pigment epithelium/choroid, and tear film) and type of assay (mass spectrometry or aptamers) used in the individual studies. Proteins that exhibited at least a 2× fold change (FC) were further analyzed through functional enrichment analysis and protein-protein interaction networks (STRING database). Results: Twenty-two studies (case-control and cohorts) with a total of 6932 participants were included. The included studies showed significant heterogeneity, and most of them lacked sufficient power. Results suggested that various proteins and pathways are implicated in AMD, and there were differences when comparing results from the individual studies and unbiased results. Although many proteins differed significantly between AMD and control groups, most exhibited less than a 2-FC. Functional analysis of proteins with ≥|2|-FCs (identified by unbiased proteomics in multiple biofluids) highlighted lipid metabolism and protease regulation pathways as central to both dry and wet AMD. Complement and coagulation cascades, chaperones, and glycolysis pathways were significant in wet AMD, whereas matrix remodeling pathways were enriched mostly in dry AMD. Conclusion: Combining proteomics from various studies could reveal new protein-protein interaction networks and associated functional pathways that may suggest novel potential therapeutic targets for AMD. However, there is a scarcity of data available for early AMD from ocular biofluids, and it should be the aim of future proteomics studies. Financial Disclosures: Proprietary or commercial disclosure may be found in the Footnotes and Disclosures at the end of this article.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: Revue systématique
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,582

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,000
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,329 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle