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Enregistrement W4409371019 · doi:10.1038/s42003-025-07963-7

The FinnBrain multimodal neonatal template and atlas collection

2025· article· en· W4409371019 sur OpenAlexafffund
Jetro J. Tuulari, Aylin Rosberg, Elmo P. Pulli, Niloofar Hashempour, Elena Ukharova, Kristian Lidauer, Ashmeet Jolly, Silja Luotonen, Hilyatushalihah K. Audah, Elena Vartiainen, Wajiha Bano, Ilkka Suuronen, Isabella Lucia Chiara Mariani Wigley, Vladimir Fonov, D. Louis Collins, Harri Merisaari, Linnéa Karlsson, Hasse Karlsson, John D. Lewis

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueSpeech and dialogue systems
Établissements canadiensMental Health Research CanadaHospital for Sick ChildrenMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesTurun Yliopistollinen KeskussairaalaTurun YliopistoHospital for Sick ChildrenAalto-YliopistoSickkids Research InstituteMcGill University
Mots-clésAtlas (anatomy)Computer scienceMedicineAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The accurate processing of neonatal and infant brain MRI data is crucial for developmental neuroscience but presents unique challenges that child and adult data do not. Tissue segmentation and image coregistration accuracy can be improved by optimizing template images and related segmentation procedures. Here, we describe the construction of the FinnBrain Neonate (FBN-125) template, a multi-contrast template with T1- and T2-weighted, as well as diffusion tensor imaging-derived fractional anisotropy and mean diffusivity images. The template is symmetric, aligned to the Talairach-like MNI-152 template, and has high spatial resolution (0.5 mm³). Additionally, we provide atlas labels, constructed from manual segmentations, for cortical grey matter, white matter, cerebrospinal fluid, brainstem, cerebellum as well as the bilateral hippocampi, amygdalae, caudate nuclei, putamina, globi pallidi, and thalami. This multi-contrast template and labelled atlases aim to advance developmental neuroscience by achieving reliable means for spatial normalization and measures of neonate brain structure via automated computational methods. We also provide standard volumetric and surface co-registration files to enable investigators to transform their statistical maps to the adult MNI space, improving the consistency and comparability of neonatal studies or the use of adult MNI space atlases in neonatal neuroimaging.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,946
Score d'incertitude au seuil0,575

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,294
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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