Transcription factors DksA and PsrA are synergistic contributors to Legionella pneumophila virulence in Acanthamoeba castellanii protozoa
Notice bibliographique
Résumé
The environmental bacterium Legionella pneumophila , an intracellular parasite of free-living freshwater protozoa as well as an opportunistic human pathogen, has a biphasic lifestyle. The switch from the vegetative replicative form to the environmentally resilient transmissive phase form is governed by a complex stringent response-based regulatory network that includes RNA polymerase co-factor DksA. Here, we report that, through a dysfunctional DksA mutation (DksA1), a synergistic interplay was discovered between DksA and transcription regulator PsrA using the Acanthamoeba castellanii protozoan infection model. Surprisingly, in trans expression of PsrA partially rescued the growth defect of a dksA1 strain. Whilst in trans expression of DksA expectantly could fully rescue the growth defect of the dksA1 strain, it could also surprisingly rescue the growth defect of a Δ psrA strain. Conversely, the severe intracellular growth defect of a Δ dksA strain could be rescued by in trans expression of DksA and DksA1, but not PsrA. In vitro phenotypic assays show that either DksA or DksA1 was required for extended culturability of bacterial cells, but normal cell morphology and pigmentation required DksA only. Comparative structural modelling predicts that the DksA1 mutation affects the coordination of Mg 2+ into the active site of RNAP, compromising transcription efficiency. Taken together, we propose that PsrA transcriptionally assists DksA in the expression of select transmissive phase traits. Additionally, in vitro evidence suggests that the long-chain fatty acid metabolic response is mediated by PsrA together with DksA, inferring a novel regulatory link to the stringent response pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».