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Enregistrement W4409490483 · doi:10.1111/1758-2229.70083

Plasmid <scp>pPNptGreen</scp> Expression of Green Fluorescent Protein in <scp> <i>Pseudomonas chlororaphis</i> </scp> Strain <scp>S1Bt23</scp> Abrogates Biocontrol Activity Against <scp> <i>Pythium ultimum</i> </scp>

2025· article· en· W4409490483 sur OpenAlexafffund
Mercy Akuma, Sylvia Ighem, Renlin Xu, Indira Thapa, Barbara A. Blackwell, James T. Tambong

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Microbiology Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of ManitobaCanadian Blood ServicesUniversity of OttawaAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésPseudomonas chlororaphisGreen fluorescent proteinPythium ultimumBiologyMicrobiologyPlasmidInoculationMolecular biologyPseudomonasBotanyRhizoctonia solaniBacteriaBiochemistryGeneHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pseudomonas chlororaphis is a highly effective plant root coloniser and biocontrol agent. To monitor the colonisation of tomato and canola roots, P. chlororaphis S1Bt23 was transformed with the pPNptGreen plasmid encoding for green fluorescent protein (S1Bt23-GFP). Seedling roots inoculated with S1Bt23-GFP were examined after 2 and 5 h using confocal laser fluorescence microscopy. Roots exposed to S1Bt23-GFP showed pronounced biofilm formation around the root surface, and fluorescing cells were localised in the epidermis and metaxylem after 2 and 5 h of inoculation, respectively. The canola roots also showed upward active translocation of the S1Bt23-GFP cells in xylem vessels in real time. S1Bt23-GFP was also evaluated for antagonistic activity against Pythium ultimum. While S1Bt23 WT exhibited 65.70%-71.4% inhibition of radial growth of Py. ultimum, the S1Bt23-GFP strain did not demonstrate any antagonistic effects. Thin layer chromatography and liquid chromatography mass spectrometry analyses of culture extracts of S1Bt23-GFP did not detect phenazines or pyrrolnitrin, antifungal metabolites identified in S1Bt23 wild type. Expressions of phenazine and pyrrolnitrin genes showed no differences in S1Bt23-GFP and wild type. This suggests that the abrogation of these metabolites occurred post-transcriptionally, probably due to a high cellular molecular load in GFP production. This could negatively impact the ecological fitness of S1Bt23-GFP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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