Plasmid <scp>pPNptGreen</scp> Expression of Green Fluorescent Protein in <scp> <i>Pseudomonas chlororaphis</i> </scp> Strain <scp>S1Bt23</scp> Abrogates Biocontrol Activity Against <scp> <i>Pythium ultimum</i> </scp>
Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas chlororaphis is a highly effective plant root coloniser and biocontrol agent. To monitor the colonisation of tomato and canola roots, P. chlororaphis S1Bt23 was transformed with the pPNptGreen plasmid encoding for green fluorescent protein (S1Bt23-GFP). Seedling roots inoculated with S1Bt23-GFP were examined after 2 and 5 h using confocal laser fluorescence microscopy. Roots exposed to S1Bt23-GFP showed pronounced biofilm formation around the root surface, and fluorescing cells were localised in the epidermis and metaxylem after 2 and 5 h of inoculation, respectively. The canola roots also showed upward active translocation of the S1Bt23-GFP cells in xylem vessels in real time. S1Bt23-GFP was also evaluated for antagonistic activity against Pythium ultimum. While S1Bt23 WT exhibited 65.70%-71.4% inhibition of radial growth of Py. ultimum, the S1Bt23-GFP strain did not demonstrate any antagonistic effects. Thin layer chromatography and liquid chromatography mass spectrometry analyses of culture extracts of S1Bt23-GFP did not detect phenazines or pyrrolnitrin, antifungal metabolites identified in S1Bt23 wild type. Expressions of phenazine and pyrrolnitrin genes showed no differences in S1Bt23-GFP and wild type. This suggests that the abrogation of these metabolites occurred post-transcriptionally, probably due to a high cellular molecular load in GFP production. This could negatively impact the ecological fitness of S1Bt23-GFP.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».