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Enregistrement W4409497395 · doi:10.1371/journal.pone.0320639

Isolation of a potentially arsenic-resistant Halomonas elongata strain (ml10562) from hypersaline systems in the Peruvian Andes, Cusco

2025· article· en· W4409497395 sur OpenAlexaff
Shirly Pila-Lacuta, David Pauccar, Jorge Rojas-Vargas, Ulises E. Rodríguez-Cruz, José Luis Sierra-Monzón, Hugo G. Castelán‐Sánchez, María Antonieta Quispe-Ricalde

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueArsenic contamination and mitigation
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHalomonasArsenicBiologyStrain (injury)MicrobiologyGenomeBioremediationHalophileGeneticsBacteriaGeneChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Halomonas elongata strain ml10562, was isolated from hypersaline that was collected from Acos Peru. Average Nucleotide Identity (ANI) and dDDH (digital DNA-DNA Hybridization) values between strain ml10562 and type strains of Halomonas elongata species were 71.0-78.4% and 18.8-21.5%, respectively. The draft genome, spanning 4,075,440 base pairs, has a GC content of 64.2% and contains 3,912 genes. Functional characterization revealed the strain's ability to tolerate and resist increasing concentrations of sodium arsenate, with a minimum inhibitory concentration of 25 mM. Bioinformatic analysis revealed the presence of two operons, arsR-arsH-arsB and arsJ-gapdh-arsC, in the genome of strain ml10562, which could play a crucial role in arsenic resistance through transporter-mediated mechanisms. Overall, these results emphasize the potential adaptability of H. elongata ml10562 to arsenic-containing environments and extend our understanding of bacterial arsenic resistance mechanisms, allowing promising applications in bioremediation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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