Genetic Comparison of Enterococcus Species Isolated from Osteomyelitis Lesions and the Barn Environment of Successive Broiler Chicken Flocks
Notice bibliographique
Résumé
Comparación genética de especies de Enterococcus aisladas de lesiones de osteomielitis y el entorno de los gallineros de lotes sucesivos de pollos de engorde. La osteomielitis causada por Enterococcus cecorum es una enfermedad emergente en pollos de engorde en Canadá. Se han reportado otras especies de Enterococcus como agentes causales en ciertos brotes. La epidemiología de esta enfermedad es desconocida, pero las casetas contaminadas se ven afectadas por episodios recurrentes. Un lote de pollos de engorde ubicado en Quebec, Canadá, presentó lesiones de osteomielitis positivas para E. cecorum y Enterococcus faecalis. Sorprendentemente, el siguiente lote, en la misma caseta, reveló la presencia de lesiones positivas por E. faecalis y Enterococcus raffinosus, pero no por E. cecorum. Para entender mejor la epidemiología de estos dos brotes, verificar la persistencia de aislamientos patógenos en la caseta e identificar la posible transferencia de material genético entre las especies de Enterococcus aisladas de ambos eventos, se secuenciaron 16 aislamientos (1 de E. cecorum, 13 de E. faecalis y 2 de E. raffinosus) y se compararon sus genomas. Curiosamente, más de una especie de Enterococcus pudo aislarse de la misma lesión, mientras que otras lesiones también revelaron varios aislamientos no clonales de la misma especie. Esto podría sugerir la naturaleza oportunista de Enterococcus spp. ya que no había un aislamiento predominante en las lesiones. El número de genes de virulencia varió de 1 a 34 en tres especies de Enterococcus sin la presencia de un gene de virulencia común. El número y la naturaleza de los genes de resistencia a los antimicrobianos entre esos aislamientos fueron preocupantes porque indican la presencia de resistencia a múltiples fármacos en la granja. Tanto los plásmidos como los fagos fueron compartidos por diferentes especies de Enterococcus, lo que sugiere una posible transferencia horizontal de genes de elementos genéticos móviles dentro de esta población de enterococos.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».