microRNA-4488 is differentially regulated during dengue virus infection and clearance of the virus
Notice bibliographique
Résumé
Dengue virus (DENV) is a zoonotic disease transmitted to humans via mosquito bites. Viral infection is systemic in humans and can lead to organ failure including in the liver. Since there are many molecular changes that precede liver failure, identification of progress at the molecular level is informative. As an RNA virus, DENV perturbs non-coding RNAs including microRNAs. Here we examine microRNA profiles in hepatoma cells using small molecule–mediated annotation of miRNA targets. It was previously shown that treatment with the broadly antiviral oxysterol 25-hydroxycholesterol (25HC) induces the expression of antiviral microRNAs in the liver. Herein, we show that 25HC is potently antiviral against Dengue virus and identify miR-4488 as a microRNA which is overexpressed during infection and downregulated with oxysterol treatment. We also show that miR-4488 is downregulated when the viral levels are lowered using siRNA, suggesting that this microRNA is involved in the host-response to infection. Since miR-4488 levels closely correlate with DENV levels in the liver, it serves as a biomarker for virus infection in the liver and may contribute the overall effects of DENV in this organ.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».