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Enregistrement W4409525813 · doi:10.3390/metabo15040277

Metabolic Effects of the Cancer Metastasis Modulator MEMO1

2025· article· en· W4409525813 sur OpenAlexafffund
Marziyeh Ghanbarian, Natalia V. Dolgova, Frederick S. Vizeacoumar, Franco J. Vizeacoumar, Déborah Michel, Anas El‐Aneed, Oleg Y. Dmitriev

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensSaskatchewan Cancer AgencyUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCitric acid cycleCell cycleCancer cellTricarboxylic acidGene knockdownCancerChemistrySmall hairpin RNABiologyBiochemistryCancer researchMetabolismCell biologyCellApoptosisGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background/Objectives: Cancer cells often display altered energy metabolism. In particular, expression levels and activity of the tricarboxylic acid cycle (TCA cycle) enzymes may change in cancer, and dysregulation of the TCA cycle is a frequent hallmark of cancer cell metabolism. MEMO1, a modulator of cancer metastasis, has been shown to bind iron and regulate iron homeostasis in the cells. MEMO1 knockout changed mitochondrial morphology and iron content in breast cancer cells. Our previous genome-wide analysis of MEMO1 genetic interactions across multiple cancer cell lines revealed that gene sets involved in mitochondrial respiration and the TCA cycle are enriched among the gain-of-function interaction partners of MEMO1. Based on these findings, we measured the TCA cycle metabolite levels in breast cancer cells with varying levels of MEMO1 expression. Methods: ShRNA knockdown assay was performed to test essentiality of key TCA cycle enzymes. TCA metabolites were quantified using liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) in MDA-MB-231 (high MEMO1), M67-2 (MEMO1 knockdown), and M67-9 (MEMO1 knockout) cells under iron-depleted, basal iron, and iron-supplemented conditions. Results:ACO2 and OGDH knockdowns inhibit cell proliferation, indicating an essential role of the TCA cycle in MDA-MB-231 metabolism. α-Ketoglutarate and citrate levels exhibited an inverse relationship with MEMO1 expression, increasing significantly in MEMO1 knockout cells regardless of iron availability. In contrast, fumarate, malate, and glutamate levels were elevated in MEMO1 knockout cells specifically under low iron conditions, suggesting an iron-dependent effect. Conclusions: Overall, our results indicate that MEMO1 plays a role in regulating the TCA in cancer cells in an iron-dependent manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,396
Score d'incertitude au seuil0,707

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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