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Enregistrement W4409561720 · doi:10.1016/j.ebiom.2025.105697

Gradual changes within long-lived influenza virus-specific CD8+ T cells are associated with the loss of public TCR clonotypes in older adults

2025· article· en· W4409561720 sur OpenAlexaff
Carolien E. van de Sandt, Hayley A. McQuilten, Malet Aban, Thi H. O. Nguyen, Sophie Valkenburg, Emma J. Grant, Sneha Sant, Jamie Rossjohn, Stéphanie Gras, Jane Crowe, Katherine Kedzierska

Notice bibliographique

RevueEBioMedicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInfluenza Virus Research Studies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesEuropean CommissionNational Health and Medical Research CouncilHorizon 2020 Framework ProgrammeH2020 Marie Skłodowska-Curie ActionsUniversity of MelbourneAustralian Research Council
Mots-clésT-cell receptorImmunologyBiologyCD8Human leukocyte antigenEpitopeInfluenza A virusCytotoxic T cellImmune systemVirologyT cellVirusAntigenGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background Susceptibility to life-threatening influenza increases with age, partly due to declining immunity. Frequency, phenotype and T-cell receptor (TCR) composition of influenza-specific CD8 + T-cells directed at the prominent A2/M1 58 influenza epitope change across the human lifespan. Methods We investigated longevity and mechanisms underlying age-related changes in influenza-specific TCR repertoires by performing longitudinal analyses in young and older adults across 7–12 years within A2/M1 58 + CD8 + T-cells using peptide-HLA tetramers directly ex vivo . Paired TCRαβ-chains were used to track clonotypes over time within individuals. Findings Expanded public and private TCR clonotypes were long-lived but gradually declined over time. Loss of public clonotypes was initially compensated by expansions of clonotypes expressing public-associated features. Once these public-associated TCR clonotypes were abated in older adults, the void was filled by expansions of less similar private TCR clonotypes. Expanded older private TCR clonotypes also declined over time and were gradually replaced by other private TCR clonotypes with low similarity to public TCR clonotypes detected in adults. Interpretation Despite our relatively small cohort, we provided conclusive evidence that CD8 + T-cells to a single HLA-A2-restricted influenza-epitope are long-lived. However, dynamic changes occur at the clonotypic level, which eventually result in loss of public clonotypes, indicating that T-cell-based influenza vaccines are likely more effective in adults than older adults. Funding This research was supported by the National Health and Medical Research Council (#1173871, #1159272), the Australian Research Council (#190102704), European Union's Horizon 2020 (#792532), the University of Melbourne. Funders had no role in design, analysis or reporting of the study.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,920

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,062
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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